Protein–RNA interactions for Protein: Q15011

HERPUD1, Homocysteine-responsive endoplasmic reticulum-resident ubiquitin-like domain member 1 protein, humanhuman

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Length 391 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERPUD1Q15011 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
HERPUD1Q15011 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
HERPUD1Q15011 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
HERPUD1Q15011 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
HERPUD1Q15011 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.99■□□□□ 0.47
HERPUD1Q15011 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
HERPUD1Q15011 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
HERPUD1Q15011 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
HERPUD1Q15011 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
HERPUD1Q15011 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
HERPUD1Q15011 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
HERPUD1Q15011 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
HERPUD1Q15011 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
HERPUD1Q15011 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
HERPUD1Q15011 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
HERPUD1Q15011 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
HERPUD1Q15011 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
HERPUD1Q15011 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
HERPUD1Q15011 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
HERPUD1Q15011 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
HERPUD1Q15011 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
HERPUD1Q15011 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
HERPUD1Q15011 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
HERPUD1Q15011 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
HERPUD1Q15011 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
HERPUD1Q15011 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
HERPUD1Q15011 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
HERPUD1Q15011 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
HERPUD1Q15011 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
HERPUD1Q15011 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
HERPUD1Q15011 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
HERPUD1Q15011 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
HERPUD1Q15011 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
HERPUD1Q15011 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
HERPUD1Q15011 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
HERPUD1Q15011 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
HERPUD1Q15011 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
HERPUD1Q15011 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
HERPUD1Q15011 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
HERPUD1Q15011 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
HERPUD1Q15011 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
HERPUD1Q15011 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
HERPUD1Q15011 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
HERPUD1Q15011 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
HERPUD1Q15011 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
HERPUD1Q15011 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
HERPUD1Q15011 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
HERPUD1Q15011 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
HERPUD1Q15011 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
HERPUD1Q15011 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
HERPUD1Q15011 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
HERPUD1Q15011 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
HERPUD1Q15011 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
HERPUD1Q15011 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
HERPUD1Q15011 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
HERPUD1Q15011 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
HERPUD1Q15011 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
HERPUD1Q15011 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
HERPUD1Q15011 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
HERPUD1Q15011 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
HERPUD1Q15011 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
HERPUD1Q15011 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
HERPUD1Q15011 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
HERPUD1Q15011 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
HERPUD1Q15011 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
HERPUD1Q15011 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
HERPUD1Q15011 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
HERPUD1Q15011 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
HERPUD1Q15011 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
HERPUD1Q15011 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
HERPUD1Q15011 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
HERPUD1Q15011 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
HERPUD1Q15011 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
HERPUD1Q15011 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
HERPUD1Q15011 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
HERPUD1Q15011 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
HERPUD1Q15011 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
HERPUD1Q15011 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
HERPUD1Q15011 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
HERPUD1Q15011 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
HERPUD1Q15011 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
HERPUD1Q15011 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
HERPUD1Q15011 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
HERPUD1Q15011 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
HERPUD1Q15011 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
HERPUD1Q15011 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
HERPUD1Q15011 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
HERPUD1Q15011 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
HERPUD1Q15011 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
HERPUD1Q15011 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
HERPUD1Q15011 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
HERPUD1Q15011 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC17.95■□□□□ 0.46
HERPUD1Q15011 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
HERPUD1Q15011 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
HERPUD1Q15011 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
HERPUD1Q15011 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
HERPUD1Q15011 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
HERPUD1Q15011 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
HERPUD1Q15011 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
HERPUD1Q15011 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
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