Protein–RNA interactions for Protein: Q15008

PSMD6, 26S proteasome non-ATPase regulatory subunit 6, humanhuman

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Length 389 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMD6Q15008 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PSMD6Q15008 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PSMD6Q15008 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PSMD6Q15008 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PSMD6Q15008 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PSMD6Q15008 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PSMD6Q15008 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PSMD6Q15008 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PSMD6Q15008 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
PSMD6Q15008 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PSMD6Q15008 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PSMD6Q15008 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PSMD6Q15008 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PSMD6Q15008 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PSMD6Q15008 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PSMD6Q15008 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PSMD6Q15008 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PSMD6Q15008 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PSMD6Q15008 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PSMD6Q15008 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PSMD6Q15008 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PSMD6Q15008 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PSMD6Q15008 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
PSMD6Q15008 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PSMD6Q15008 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PSMD6Q15008 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PSMD6Q15008 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PSMD6Q15008 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PSMD6Q15008 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PSMD6Q15008 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PSMD6Q15008 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PSMD6Q15008 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PSMD6Q15008 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
PSMD6Q15008 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PSMD6Q15008 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PSMD6Q15008 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PSMD6Q15008 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
PSMD6Q15008 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PSMD6Q15008 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PSMD6Q15008 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PSMD6Q15008 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
PSMD6Q15008 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PSMD6Q15008 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PSMD6Q15008 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PSMD6Q15008 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PSMD6Q15008 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PSMD6Q15008 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
PSMD6Q15008 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PSMD6Q15008 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PSMD6Q15008 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
PSMD6Q15008 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PSMD6Q15008 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PSMD6Q15008 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PSMD6Q15008 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PSMD6Q15008 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PSMD6Q15008 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PSMD6Q15008 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PSMD6Q15008 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PSMD6Q15008 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PSMD6Q15008 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PSMD6Q15008 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PSMD6Q15008 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PSMD6Q15008 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PSMD6Q15008 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PSMD6Q15008 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.31
PSMD6Q15008 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PSMD6Q15008 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PSMD6Q15008 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PSMD6Q15008 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PSMD6Q15008 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PSMD6Q15008 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PSMD6Q15008 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PSMD6Q15008 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PSMD6Q15008 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PSMD6Q15008 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PSMD6Q15008 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PSMD6Q15008 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PSMD6Q15008 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
PSMD6Q15008 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PSMD6Q15008 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PSMD6Q15008 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PSMD6Q15008 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PSMD6Q15008 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PSMD6Q15008 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PSMD6Q15008 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PSMD6Q15008 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PSMD6Q15008 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PSMD6Q15008 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PSMD6Q15008 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PSMD6Q15008 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PSMD6Q15008 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
PSMD6Q15008 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PSMD6Q15008 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PSMD6Q15008 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PSMD6Q15008 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PSMD6Q15008 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PSMD6Q15008 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PSMD6Q15008 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PSMD6Q15008 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PSMD6Q15008 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
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