Protein–RNA interactions for Protein: Q149M9

NWD1, NACHT domain- and WD repeat-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,564 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NWD1Q149M9 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
NWD1Q149M9 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
NWD1Q149M9 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC30.34■■■□□ 2.45
NWD1Q149M9 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
NWD1Q149M9 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC30.34■■■□□ 2.45
NWD1Q149M9 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
NWD1Q149M9 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
NWD1Q149M9 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC30.33■■■□□ 2.45
NWD1Q149M9 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
NWD1Q149M9 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
NWD1Q149M9 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC30.33■■■□□ 2.45
NWD1Q149M9 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC30.33■■■□□ 2.45
NWD1Q149M9 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC30.33■■■□□ 2.45
NWD1Q149M9 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.45
NWD1Q149M9 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC30.32■■■□□ 2.45
NWD1Q149M9 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC30.32■■■□□ 2.45
NWD1Q149M9 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.45
NWD1Q149M9 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.32■■■□□ 2.45
NWD1Q149M9 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC30.32■■■□□ 2.45
NWD1Q149M9 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC30.32■■■□□ 2.45
NWD1Q149M9 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC30.32■■■□□ 2.45
NWD1Q149M9 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC30.32■■■□□ 2.45
NWD1Q149M9 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
NWD1Q149M9 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC30.32■■■□□ 2.44
NWD1Q149M9 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
NWD1Q149M9 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.32■■■□□ 2.44
NWD1Q149M9 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
NWD1Q149M9 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
NWD1Q149M9 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC30.32■■■□□ 2.44
NWD1Q149M9 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC30.31■■■□□ 2.44
NWD1Q149M9 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.31■■■□□ 2.44
NWD1Q149M9 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC30.31■■■□□ 2.44
NWD1Q149M9 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC30.31■■■□□ 2.44
NWD1Q149M9 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.31■■■□□ 2.44
NWD1Q149M9 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC30.3■■■□□ 2.44
NWD1Q149M9 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC30.3■■■□□ 2.44
NWD1Q149M9 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
NWD1Q149M9 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
NWD1Q149M9 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC30.3■■■□□ 2.44
NWD1Q149M9 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC30.3■■■□□ 2.44
NWD1Q149M9 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
NWD1Q149M9 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC30.3■■■□□ 2.44
NWD1Q149M9 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
NWD1Q149M9 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
NWD1Q149M9 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
NWD1Q149M9 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC30.29■■■□□ 2.44
NWD1Q149M9 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
NWD1Q149M9 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
NWD1Q149M9 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
NWD1Q149M9 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC30.28■■■□□ 2.44
NWD1Q149M9 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.28■■■□□ 2.44
NWD1Q149M9 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC30.28■■■□□ 2.44
NWD1Q149M9 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC30.28■■■□□ 2.44
NWD1Q149M9 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
NWD1Q149M9 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
NWD1Q149M9 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
NWD1Q149M9 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
NWD1Q149M9 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
NWD1Q149M9 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC30.28■■■□□ 2.44
NWD1Q149M9 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC30.28■■■□□ 2.44
NWD1Q149M9 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
NWD1Q149M9 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC30.28■■■□□ 2.44
NWD1Q149M9 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC30.28■■■□□ 2.44
NWD1Q149M9 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
NWD1Q149M9 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
NWD1Q149M9 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC30.27■■■□□ 2.44
NWD1Q149M9 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
NWD1Q149M9 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC30.27■■■□□ 2.44
NWD1Q149M9 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
NWD1Q149M9 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC30.27■■■□□ 2.44
NWD1Q149M9 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
NWD1Q149M9 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.27■■■□□ 2.44
NWD1Q149M9 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC30.26■■■□□ 2.44
NWD1Q149M9 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC30.26■■■□□ 2.44
NWD1Q149M9 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.44
NWD1Q149M9 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
NWD1Q149M9 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.26■■■□□ 2.43
NWD1Q149M9 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.26■■■□□ 2.43
NWD1Q149M9 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC30.26■■■□□ 2.43
NWD1Q149M9 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC30.26■■■□□ 2.43
NWD1Q149M9 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
NWD1Q149M9 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC30.25■■■□□ 2.43
NWD1Q149M9 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC30.25■■■□□ 2.43
NWD1Q149M9 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC30.25■■■□□ 2.43
NWD1Q149M9 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
NWD1Q149M9 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC30.25■■■□□ 2.43
NWD1Q149M9 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
NWD1Q149M9 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
NWD1Q149M9 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC30.24■■■□□ 2.43
NWD1Q149M9 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC30.24■■■□□ 2.43
NWD1Q149M9 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
NWD1Q149M9 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC30.24■■■□□ 2.43
NWD1Q149M9 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC30.24■■■□□ 2.43
NWD1Q149M9 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
NWD1Q149M9 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
NWD1Q149M9 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
NWD1Q149M9 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
NWD1Q149M9 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
NWD1Q149M9 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
NWD1Q149M9 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.4 ms