Protein–RNA interactions for Protein: Q14596

NBR1, Next to BRCA1 gene 1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 966 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NBR1Q14596 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
NBR1Q14596 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
NBR1Q14596 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC26.32■■□□□ 1.8
NBR1Q14596 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
NBR1Q14596 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
NBR1Q14596 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
NBR1Q14596 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
NBR1Q14596 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
NBR1Q14596 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
NBR1Q14596 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
NBR1Q14596 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
NBR1Q14596 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
NBR1Q14596 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
NBR1Q14596 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
NBR1Q14596 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
NBR1Q14596 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
NBR1Q14596 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
NBR1Q14596 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
NBR1Q14596 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
NBR1Q14596 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
NBR1Q14596 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
NBR1Q14596 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
NBR1Q14596 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
NBR1Q14596 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
NBR1Q14596 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
NBR1Q14596 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
NBR1Q14596 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
NBR1Q14596 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
NBR1Q14596 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
NBR1Q14596 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
NBR1Q14596 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
NBR1Q14596 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
NBR1Q14596 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
NBR1Q14596 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
NBR1Q14596 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
NBR1Q14596 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
NBR1Q14596 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
NBR1Q14596 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
NBR1Q14596 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
NBR1Q14596 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
NBR1Q14596 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
NBR1Q14596 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC26.29■■□□□ 1.8
NBR1Q14596 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
NBR1Q14596 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC26.29■■□□□ 1.8
NBR1Q14596 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
NBR1Q14596 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
NBR1Q14596 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
NBR1Q14596 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
NBR1Q14596 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
NBR1Q14596 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
NBR1Q14596 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
NBR1Q14596 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
NBR1Q14596 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
NBR1Q14596 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
NBR1Q14596 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
NBR1Q14596 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
NBR1Q14596 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC26.28■■□□□ 1.8
NBR1Q14596 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC26.28■■□□□ 1.8
NBR1Q14596 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
NBR1Q14596 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
NBR1Q14596 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
NBR1Q14596 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
NBR1Q14596 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
NBR1Q14596 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
NBR1Q14596 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
NBR1Q14596 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
NBR1Q14596 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
NBR1Q14596 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
NBR1Q14596 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
NBR1Q14596 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
NBR1Q14596 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
NBR1Q14596 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
NBR1Q14596 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
NBR1Q14596 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
NBR1Q14596 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
NBR1Q14596 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
NBR1Q14596 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
NBR1Q14596 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
NBR1Q14596 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
NBR1Q14596 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
NBR1Q14596 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
NBR1Q14596 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
NBR1Q14596 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
NBR1Q14596 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
NBR1Q14596 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
NBR1Q14596 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
NBR1Q14596 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
NBR1Q14596 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
NBR1Q14596 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
NBR1Q14596 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
NBR1Q14596 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
NBR1Q14596 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
NBR1Q14596 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
NBR1Q14596 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
NBR1Q14596 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
NBR1Q14596 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
NBR1Q14596 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
NBR1Q14596 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
NBR1Q14596 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC26.25■■□□□ 1.79
NBR1Q14596 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.2 ms