Protein–RNA interactions for Protein: Q14511

NEDD9, Enhancer of filamentation 1, humanhuman

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Length 834 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD9Q14511 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
NEDD9Q14511 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
NEDD9Q14511 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
NEDD9Q14511 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
NEDD9Q14511 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
NEDD9Q14511 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
NEDD9Q14511 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
NEDD9Q14511 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
NEDD9Q14511 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
NEDD9Q14511 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
NEDD9Q14511 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
NEDD9Q14511 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
NEDD9Q14511 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
NEDD9Q14511 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
NEDD9Q14511 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
NEDD9Q14511 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
NEDD9Q14511 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
NEDD9Q14511 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
NEDD9Q14511 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
NEDD9Q14511 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
NEDD9Q14511 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
NEDD9Q14511 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
NEDD9Q14511 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
NEDD9Q14511 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
NEDD9Q14511 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
NEDD9Q14511 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
NEDD9Q14511 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
NEDD9Q14511 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
NEDD9Q14511 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
NEDD9Q14511 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
NEDD9Q14511 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
NEDD9Q14511 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
NEDD9Q14511 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
NEDD9Q14511 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
NEDD9Q14511 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
NEDD9Q14511 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
NEDD9Q14511 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
NEDD9Q14511 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC24.2■■□□□ 1.46
NEDD9Q14511 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC24.2■■□□□ 1.46
NEDD9Q14511 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
NEDD9Q14511 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
NEDD9Q14511 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
NEDD9Q14511 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
NEDD9Q14511 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
NEDD9Q14511 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
NEDD9Q14511 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
NEDD9Q14511 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
NEDD9Q14511 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
NEDD9Q14511 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
NEDD9Q14511 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
NEDD9Q14511 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
NEDD9Q14511 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
NEDD9Q14511 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NEDD9Q14511 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NEDD9Q14511 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NEDD9Q14511 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
NEDD9Q14511 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
NEDD9Q14511 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NEDD9Q14511 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NEDD9Q14511 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
NEDD9Q14511 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
NEDD9Q14511 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
NEDD9Q14511 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
NEDD9Q14511 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
NEDD9Q14511 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
NEDD9Q14511 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
NEDD9Q14511 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
NEDD9Q14511 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
NEDD9Q14511 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
NEDD9Q14511 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
NEDD9Q14511 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
NEDD9Q14511 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
NEDD9Q14511 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
NEDD9Q14511 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
NEDD9Q14511 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
NEDD9Q14511 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
NEDD9Q14511 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
NEDD9Q14511 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
NEDD9Q14511 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
NEDD9Q14511 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
NEDD9Q14511 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
NEDD9Q14511 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
NEDD9Q14511 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
NEDD9Q14511 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
NEDD9Q14511 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
NEDD9Q14511 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
NEDD9Q14511 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
NEDD9Q14511 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
NEDD9Q14511 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
NEDD9Q14511 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
NEDD9Q14511 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
NEDD9Q14511 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
NEDD9Q14511 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
NEDD9Q14511 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
NEDD9Q14511 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
NEDD9Q14511 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
NEDD9Q14511 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
NEDD9Q14511 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
NEDD9Q14511 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
NEDD9Q14511 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
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