Protein–RNA interactions for Protein: Q14162

SCARF1, Scavenger receptor class F member 1, humanhuman

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Length 830 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCARF1Q14162 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
SCARF1Q14162 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
SCARF1Q14162 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
SCARF1Q14162 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
SCARF1Q14162 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
SCARF1Q14162 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
SCARF1Q14162 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
SCARF1Q14162 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
SCARF1Q14162 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC26.33■■□□□ 1.81
SCARF1Q14162 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
SCARF1Q14162 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC26.33■■□□□ 1.81
SCARF1Q14162 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
SCARF1Q14162 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
SCARF1Q14162 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
SCARF1Q14162 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
SCARF1Q14162 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
SCARF1Q14162 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
SCARF1Q14162 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
SCARF1Q14162 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
SCARF1Q14162 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
SCARF1Q14162 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
SCARF1Q14162 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
SCARF1Q14162 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
SCARF1Q14162 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
SCARF1Q14162 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
SCARF1Q14162 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
SCARF1Q14162 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC26.32■■□□□ 1.8
SCARF1Q14162 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
SCARF1Q14162 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
SCARF1Q14162 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
SCARF1Q14162 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
SCARF1Q14162 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
SCARF1Q14162 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
SCARF1Q14162 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
SCARF1Q14162 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
SCARF1Q14162 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
SCARF1Q14162 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
SCARF1Q14162 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
SCARF1Q14162 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
SCARF1Q14162 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
SCARF1Q14162 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
SCARF1Q14162 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
SCARF1Q14162 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
SCARF1Q14162 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
SCARF1Q14162 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
SCARF1Q14162 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
SCARF1Q14162 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
SCARF1Q14162 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
SCARF1Q14162 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
SCARF1Q14162 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
SCARF1Q14162 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC26.3■■□□□ 1.8
SCARF1Q14162 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
SCARF1Q14162 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
SCARF1Q14162 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
SCARF1Q14162 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
SCARF1Q14162 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
SCARF1Q14162 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
SCARF1Q14162 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
SCARF1Q14162 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
SCARF1Q14162 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
SCARF1Q14162 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
SCARF1Q14162 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
SCARF1Q14162 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
SCARF1Q14162 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
SCARF1Q14162 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
SCARF1Q14162 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
SCARF1Q14162 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
SCARF1Q14162 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
SCARF1Q14162 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC26.28■■□□□ 1.8
SCARF1Q14162 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
SCARF1Q14162 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
SCARF1Q14162 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
SCARF1Q14162 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
SCARF1Q14162 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
SCARF1Q14162 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
SCARF1Q14162 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
SCARF1Q14162 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
SCARF1Q14162 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
SCARF1Q14162 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
SCARF1Q14162 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
SCARF1Q14162 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
SCARF1Q14162 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
SCARF1Q14162 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
SCARF1Q14162 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
SCARF1Q14162 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
SCARF1Q14162 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
SCARF1Q14162 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
SCARF1Q14162 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
SCARF1Q14162 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
SCARF1Q14162 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
SCARF1Q14162 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
SCARF1Q14162 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
SCARF1Q14162 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
SCARF1Q14162 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
SCARF1Q14162 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
SCARF1Q14162 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC26.26■■□□□ 1.79
SCARF1Q14162 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
SCARF1Q14162 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
SCARF1Q14162 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
SCARF1Q14162 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
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