Protein–RNA interactions for Protein: Q14123

PDE1C, Calcium/calmodulin-dependent 3',5'-cyclic nucleotide phosphodiesterase 1C, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 709 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE1CQ14123 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PDE1CQ14123 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PDE1CQ14123 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PDE1CQ14123 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PDE1CQ14123 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PDE1CQ14123 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
PDE1CQ14123 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
PDE1CQ14123 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PDE1CQ14123 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PDE1CQ14123 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PDE1CQ14123 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PDE1CQ14123 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PDE1CQ14123 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PDE1CQ14123 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PDE1CQ14123 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PDE1CQ14123 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PDE1CQ14123 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PDE1CQ14123 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PDE1CQ14123 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PDE1CQ14123 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PDE1CQ14123 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PDE1CQ14123 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PDE1CQ14123 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PDE1CQ14123 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PDE1CQ14123 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
PDE1CQ14123 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PDE1CQ14123 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PDE1CQ14123 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PDE1CQ14123 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PDE1CQ14123 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PDE1CQ14123 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PDE1CQ14123 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PDE1CQ14123 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PDE1CQ14123 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PDE1CQ14123 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PDE1CQ14123 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PDE1CQ14123 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PDE1CQ14123 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PDE1CQ14123 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PDE1CQ14123 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PDE1CQ14123 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PDE1CQ14123 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PDE1CQ14123 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PDE1CQ14123 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PDE1CQ14123 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PDE1CQ14123 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
PDE1CQ14123 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PDE1CQ14123 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PDE1CQ14123 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PDE1CQ14123 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PDE1CQ14123 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PDE1CQ14123 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PDE1CQ14123 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PDE1CQ14123 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PDE1CQ14123 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PDE1CQ14123 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PDE1CQ14123 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PDE1CQ14123 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PDE1CQ14123 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PDE1CQ14123 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PDE1CQ14123 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PDE1CQ14123 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PDE1CQ14123 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PDE1CQ14123 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PDE1CQ14123 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PDE1CQ14123 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PDE1CQ14123 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PDE1CQ14123 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PDE1CQ14123 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PDE1CQ14123 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PDE1CQ14123 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PDE1CQ14123 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PDE1CQ14123 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PDE1CQ14123 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PDE1CQ14123 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PDE1CQ14123 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PDE1CQ14123 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PDE1CQ14123 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
PDE1CQ14123 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PDE1CQ14123 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PDE1CQ14123 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
PDE1CQ14123 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PDE1CQ14123 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
PDE1CQ14123 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PDE1CQ14123 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
PDE1CQ14123 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
PDE1CQ14123 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PDE1CQ14123 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
PDE1CQ14123 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
PDE1CQ14123 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PDE1CQ14123 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PDE1CQ14123 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PDE1CQ14123 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PDE1CQ14123 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PDE1CQ14123 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PDE1CQ14123 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PDE1CQ14123 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PDE1CQ14123 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PDE1CQ14123 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PDE1CQ14123 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
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