Protein–RNA interactions for Protein: Q13889

GTF2H3, General transcription factor IIH subunit 3, humanhuman

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Length 308 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2H3Q13889 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
GTF2H3Q13889 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
GTF2H3Q13889 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC21.32■■□□□ 1
GTF2H3Q13889 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
GTF2H3Q13889 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
GTF2H3Q13889 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
GTF2H3Q13889 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
GTF2H3Q13889 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
GTF2H3Q13889 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
GTF2H3Q13889 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
GTF2H3Q13889 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
GTF2H3Q13889 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
GTF2H3Q13889 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
GTF2H3Q13889 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC21.31■■□□□ 1
GTF2H3Q13889 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
GTF2H3Q13889 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
GTF2H3Q13889 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
GTF2H3Q13889 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC21.3■■□□□ 1
GTF2H3Q13889 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
GTF2H3Q13889 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
GTF2H3Q13889 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
GTF2H3Q13889 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
GTF2H3Q13889 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
GTF2H3Q13889 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
GTF2H3Q13889 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
GTF2H3Q13889 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
GTF2H3Q13889 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
GTF2H3Q13889 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
GTF2H3Q13889 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
GTF2H3Q13889 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
GTF2H3Q13889 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
GTF2H3Q13889 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
GTF2H3Q13889 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GTF2H3Q13889 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GTF2H3Q13889 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GTF2H3Q13889 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GTF2H3Q13889 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GTF2H3Q13889 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GTF2H3Q13889 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GTF2H3Q13889 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
GTF2H3Q13889 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
GTF2H3Q13889 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC21.29■■□□□ 1
GTF2H3Q13889 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
GTF2H3Q13889 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC21.29■■□□□ 1
GTF2H3Q13889 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GTF2H3Q13889 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GTF2H3Q13889 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GTF2H3Q13889 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
GTF2H3Q13889 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
GTF2H3Q13889 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC21.28■■□□□ 1
GTF2H3Q13889 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
GTF2H3Q13889 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
GTF2H3Q13889 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC21.28■■□□□ 1
GTF2H3Q13889 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
GTF2H3Q13889 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
GTF2H3Q13889 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
GTF2H3Q13889 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
GTF2H3Q13889 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
GTF2H3Q13889 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
GTF2H3Q13889 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
GTF2H3Q13889 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
GTF2H3Q13889 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
GTF2H3Q13889 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
GTF2H3Q13889 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
GTF2H3Q13889 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
GTF2H3Q13889 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
GTF2H3Q13889 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC21.27■■□□□ 1
GTF2H3Q13889 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC21.27■■□□□ 1
GTF2H3Q13889 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
GTF2H3Q13889 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC21.27■■□□□ 1
GTF2H3Q13889 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
GTF2H3Q13889 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC21.27■■□□□ 1
GTF2H3Q13889 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
GTF2H3Q13889 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
GTF2H3Q13889 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
GTF2H3Q13889 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
GTF2H3Q13889 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
GTF2H3Q13889 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
GTF2H3Q13889 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
GTF2H3Q13889 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
GTF2H3Q13889 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
GTF2H3Q13889 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
GTF2H3Q13889 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
GTF2H3Q13889 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
GTF2H3Q13889 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
GTF2H3Q13889 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
GTF2H3Q13889 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
GTF2H3Q13889 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
GTF2H3Q13889 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
GTF2H3Q13889 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
GTF2H3Q13889 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
GTF2H3Q13889 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
GTF2H3Q13889 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
GTF2H3Q13889 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
GTF2H3Q13889 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
GTF2H3Q13889 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
GTF2H3Q13889 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
GTF2H3Q13889 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
GTF2H3Q13889 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
GTF2H3Q13889 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
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