Protein–RNA interactions for Protein: Q13829

TNFAIP1, BTB/POZ domain-containing adapter for CUL3-mediated RhoA degradation protein 2, humanhuman

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Length 316 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFAIP1Q13829 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
TNFAIP1Q13829 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
TNFAIP1Q13829 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
TNFAIP1Q13829 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
TNFAIP1Q13829 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
TNFAIP1Q13829 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
TNFAIP1Q13829 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
TNFAIP1Q13829 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
TNFAIP1Q13829 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
TNFAIP1Q13829 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
TNFAIP1Q13829 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
TNFAIP1Q13829 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC25.5■■□□□ 1.67
TNFAIP1Q13829 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
TNFAIP1Q13829 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
TNFAIP1Q13829 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
TNFAIP1Q13829 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
TNFAIP1Q13829 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
TNFAIP1Q13829 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
TNFAIP1Q13829 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC25.49■■□□□ 1.67
TNFAIP1Q13829 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
TNFAIP1Q13829 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
TNFAIP1Q13829 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
TNFAIP1Q13829 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
TNFAIP1Q13829 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
TNFAIP1Q13829 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
TNFAIP1Q13829 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
TNFAIP1Q13829 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
TNFAIP1Q13829 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
TNFAIP1Q13829 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
TNFAIP1Q13829 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
TNFAIP1Q13829 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
TNFAIP1Q13829 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
TNFAIP1Q13829 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
TNFAIP1Q13829 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
TNFAIP1Q13829 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
TNFAIP1Q13829 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
TNFAIP1Q13829 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
TNFAIP1Q13829 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
TNFAIP1Q13829 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
TNFAIP1Q13829 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
TNFAIP1Q13829 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
TNFAIP1Q13829 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
TNFAIP1Q13829 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
TNFAIP1Q13829 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
TNFAIP1Q13829 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
TNFAIP1Q13829 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
TNFAIP1Q13829 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
TNFAIP1Q13829 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
TNFAIP1Q13829 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
TNFAIP1Q13829 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
TNFAIP1Q13829 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
TNFAIP1Q13829 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
TNFAIP1Q13829 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
TNFAIP1Q13829 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
TNFAIP1Q13829 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
TNFAIP1Q13829 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
TNFAIP1Q13829 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
TNFAIP1Q13829 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
TNFAIP1Q13829 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
TNFAIP1Q13829 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
TNFAIP1Q13829 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
TNFAIP1Q13829 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
TNFAIP1Q13829 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
TNFAIP1Q13829 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
TNFAIP1Q13829 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
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TNFAIP1Q13829 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
TNFAIP1Q13829 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
TNFAIP1Q13829 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
TNFAIP1Q13829 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
TNFAIP1Q13829 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
TNFAIP1Q13829 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
TNFAIP1Q13829 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
TNFAIP1Q13829 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
TNFAIP1Q13829 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
TNFAIP1Q13829 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
TNFAIP1Q13829 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
TNFAIP1Q13829 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC25.44■■□□□ 1.66
TNFAIP1Q13829 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
TNFAIP1Q13829 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
TNFAIP1Q13829 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
TNFAIP1Q13829 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
TNFAIP1Q13829 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
TNFAIP1Q13829 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
TNFAIP1Q13829 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
TNFAIP1Q13829 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
TNFAIP1Q13829 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
TNFAIP1Q13829 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
TNFAIP1Q13829 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
TNFAIP1Q13829 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
TNFAIP1Q13829 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
TNFAIP1Q13829 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
TNFAIP1Q13829 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
TNFAIP1Q13829 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
TNFAIP1Q13829 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
TNFAIP1Q13829 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
TNFAIP1Q13829 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
TNFAIP1Q13829 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
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