Protein–RNA interactions for Protein: Q13608

PEX6, Peroxisome assembly factor 2, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PEX6Q13608 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PEX6Q13608 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PEX6Q13608 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PEX6Q13608 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PEX6Q13608 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PEX6Q13608 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PEX6Q13608 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PEX6Q13608 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PEX6Q13608 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PEX6Q13608 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
PEX6Q13608 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PEX6Q13608 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PEX6Q13608 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PEX6Q13608 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PEX6Q13608 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PEX6Q13608 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PEX6Q13608 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PEX6Q13608 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PEX6Q13608 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PEX6Q13608 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PEX6Q13608 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
PEX6Q13608 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
PEX6Q13608 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PEX6Q13608 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PEX6Q13608 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PEX6Q13608 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PEX6Q13608 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PEX6Q13608 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PEX6Q13608 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PEX6Q13608 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PEX6Q13608 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PEX6Q13608 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PEX6Q13608 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PEX6Q13608 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PEX6Q13608 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PEX6Q13608 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PEX6Q13608 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PEX6Q13608 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PEX6Q13608 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PEX6Q13608 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
PEX6Q13608 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PEX6Q13608 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
PEX6Q13608 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PEX6Q13608 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PEX6Q13608 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PEX6Q13608 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PEX6Q13608 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PEX6Q13608 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PEX6Q13608 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PEX6Q13608 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PEX6Q13608 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PEX6Q13608 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PEX6Q13608 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PEX6Q13608 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PEX6Q13608 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
PEX6Q13608 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PEX6Q13608 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
PEX6Q13608 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PEX6Q13608 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PEX6Q13608 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PEX6Q13608 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PEX6Q13608 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PEX6Q13608 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PEX6Q13608 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PEX6Q13608 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PEX6Q13608 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PEX6Q13608 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PEX6Q13608 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PEX6Q13608 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PEX6Q13608 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PEX6Q13608 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
PEX6Q13608 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PEX6Q13608 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PEX6Q13608 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PEX6Q13608 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PEX6Q13608 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PEX6Q13608 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
PEX6Q13608 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
PEX6Q13608 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
PEX6Q13608 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
PEX6Q13608 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
PEX6Q13608 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
PEX6Q13608 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
PEX6Q13608 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PEX6Q13608 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
PEX6Q13608 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
PEX6Q13608 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
PEX6Q13608 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PEX6Q13608 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PEX6Q13608 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PEX6Q13608 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PEX6Q13608 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PEX6Q13608 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
PEX6Q13608 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PEX6Q13608 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PEX6Q13608 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PEX6Q13608 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PEX6Q13608 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PEX6Q13608 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PEX6Q13608 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
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