Protein–RNA interactions for Protein: Q13573

SNW1, SNW domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 536 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNW1Q13573 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SNW1Q13573 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SNW1Q13573 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SNW1Q13573 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SNW1Q13573 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SNW1Q13573 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SNW1Q13573 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SNW1Q13573 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
SNW1Q13573 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
SNW1Q13573 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
SNW1Q13573 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
SNW1Q13573 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SNW1Q13573 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SNW1Q13573 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SNW1Q13573 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SNW1Q13573 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SNW1Q13573 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SNW1Q13573 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SNW1Q13573 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SNW1Q13573 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SNW1Q13573 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SNW1Q13573 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SNW1Q13573 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SNW1Q13573 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SNW1Q13573 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SNW1Q13573 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SNW1Q13573 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SNW1Q13573 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SNW1Q13573 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SNW1Q13573 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SNW1Q13573 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SNW1Q13573 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SNW1Q13573 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SNW1Q13573 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SNW1Q13573 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SNW1Q13573 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SNW1Q13573 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
SNW1Q13573 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SNW1Q13573 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SNW1Q13573 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SNW1Q13573 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SNW1Q13573 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SNW1Q13573 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SNW1Q13573 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SNW1Q13573 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
SNW1Q13573 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SNW1Q13573 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SNW1Q13573 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SNW1Q13573 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
SNW1Q13573 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SNW1Q13573 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SNW1Q13573 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SNW1Q13573 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SNW1Q13573 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
SNW1Q13573 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
SNW1Q13573 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
SNW1Q13573 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
SNW1Q13573 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
SNW1Q13573 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
SNW1Q13573 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
SNW1Q13573 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
SNW1Q13573 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
SNW1Q13573 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
SNW1Q13573 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
SNW1Q13573 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
SNW1Q13573 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
SNW1Q13573 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
SNW1Q13573 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
SNW1Q13573 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
SNW1Q13573 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
SNW1Q13573 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SNW1Q13573 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SNW1Q13573 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SNW1Q13573 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SNW1Q13573 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SNW1Q13573 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SNW1Q13573 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SNW1Q13573 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SNW1Q13573 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SNW1Q13573 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SNW1Q13573 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SNW1Q13573 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SNW1Q13573 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SNW1Q13573 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SNW1Q13573 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SNW1Q13573 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SNW1Q13573 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SNW1Q13573 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SNW1Q13573 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SNW1Q13573 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SNW1Q13573 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SNW1Q13573 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SNW1Q13573 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SNW1Q13573 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SNW1Q13573 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SNW1Q13573 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SNW1Q13573 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SNW1Q13573 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SNW1Q13573 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SNW1Q13573 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
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