Protein–RNA interactions for Protein: Q13564

NAE1, NEDD8-activating enzyme E1 regulatory subunit, humanhuman

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Length 534 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NAE1Q13564 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
NAE1Q13564 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
NAE1Q13564 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
NAE1Q13564 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
NAE1Q13564 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
NAE1Q13564 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
NAE1Q13564 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
NAE1Q13564 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
NAE1Q13564 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC20.88■□□□□ 0.93
NAE1Q13564 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
NAE1Q13564 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC20.88■□□□□ 0.93
NAE1Q13564 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
NAE1Q13564 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
NAE1Q13564 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
NAE1Q13564 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
NAE1Q13564 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
NAE1Q13564 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
NAE1Q13564 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
NAE1Q13564 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
NAE1Q13564 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
NAE1Q13564 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
NAE1Q13564 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
NAE1Q13564 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
NAE1Q13564 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
NAE1Q13564 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
NAE1Q13564 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC20.87■□□□□ 0.93
NAE1Q13564 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
NAE1Q13564 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
NAE1Q13564 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
NAE1Q13564 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
NAE1Q13564 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
NAE1Q13564 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
NAE1Q13564 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
NAE1Q13564 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
NAE1Q13564 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC20.86■□□□□ 0.93
NAE1Q13564 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC20.86■□□□□ 0.93
NAE1Q13564 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
NAE1Q13564 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
NAE1Q13564 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
NAE1Q13564 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
NAE1Q13564 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
NAE1Q13564 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
NAE1Q13564 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
NAE1Q13564 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
NAE1Q13564 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
NAE1Q13564 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
NAE1Q13564 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
NAE1Q13564 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
NAE1Q13564 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
NAE1Q13564 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC20.85■□□□□ 0.93
NAE1Q13564 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
NAE1Q13564 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
NAE1Q13564 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
NAE1Q13564 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
NAE1Q13564 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
NAE1Q13564 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
NAE1Q13564 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
NAE1Q13564 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
NAE1Q13564 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
NAE1Q13564 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
NAE1Q13564 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
NAE1Q13564 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
NAE1Q13564 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
NAE1Q13564 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
NAE1Q13564 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
NAE1Q13564 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
NAE1Q13564 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
NAE1Q13564 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
NAE1Q13564 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
NAE1Q13564 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
NAE1Q13564 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
NAE1Q13564 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
NAE1Q13564 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
NAE1Q13564 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
NAE1Q13564 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
NAE1Q13564 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
NAE1Q13564 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
NAE1Q13564 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.93
NAE1Q13564 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
NAE1Q13564 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
NAE1Q13564 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.92
NAE1Q13564 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
NAE1Q13564 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
NAE1Q13564 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
NAE1Q13564 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
NAE1Q13564 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
NAE1Q13564 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
NAE1Q13564 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
NAE1Q13564 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
NAE1Q13564 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
NAE1Q13564 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
NAE1Q13564 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
NAE1Q13564 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
NAE1Q13564 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
NAE1Q13564 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
NAE1Q13564 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
NAE1Q13564 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
NAE1Q13564 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
NAE1Q13564 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
NAE1Q13564 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
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