Protein–RNA interactions for Protein: Q13461

FOXE3, Forkhead box protein E3, humanhuman

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Length 319 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXE3Q13461 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
FOXE3Q13461 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
FOXE3Q13461 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
FOXE3Q13461 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
FOXE3Q13461 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
FOXE3Q13461 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
FOXE3Q13461 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
FOXE3Q13461 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
FOXE3Q13461 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
FOXE3Q13461 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
FOXE3Q13461 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
FOXE3Q13461 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
FOXE3Q13461 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
FOXE3Q13461 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
FOXE3Q13461 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
FOXE3Q13461 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
FOXE3Q13461 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
FOXE3Q13461 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
FOXE3Q13461 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
FOXE3Q13461 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
FOXE3Q13461 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
FOXE3Q13461 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
FOXE3Q13461 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
FOXE3Q13461 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
FOXE3Q13461 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
FOXE3Q13461 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
FOXE3Q13461 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
FOXE3Q13461 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
FOXE3Q13461 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
FOXE3Q13461 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
FOXE3Q13461 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
FOXE3Q13461 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
FOXE3Q13461 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
FOXE3Q13461 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
FOXE3Q13461 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
FOXE3Q13461 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
FOXE3Q13461 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
FOXE3Q13461 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
FOXE3Q13461 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
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FOXE3Q13461 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC16.85■□□□□ 0.29
FOXE3Q13461 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
FOXE3Q13461 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
FOXE3Q13461 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
FOXE3Q13461 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
FOXE3Q13461 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
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FOXE3Q13461 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
FOXE3Q13461 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
FOXE3Q13461 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
FOXE3Q13461 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
FOXE3Q13461 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
FOXE3Q13461 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
FOXE3Q13461 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
FOXE3Q13461 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
FOXE3Q13461 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
FOXE3Q13461 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
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FOXE3Q13461 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
FOXE3Q13461 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
FOXE3Q13461 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
FOXE3Q13461 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC16.85■□□□□ 0.29
FOXE3Q13461 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
FOXE3Q13461 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
FOXE3Q13461 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
FOXE3Q13461 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
FOXE3Q13461 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
FOXE3Q13461 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
FOXE3Q13461 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
FOXE3Q13461 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
FOXE3Q13461 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
FOXE3Q13461 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
FOXE3Q13461 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
FOXE3Q13461 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
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FOXE3Q13461 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
FOXE3Q13461 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
FOXE3Q13461 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
FOXE3Q13461 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
FOXE3Q13461 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
FOXE3Q13461 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
FOXE3Q13461 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
FOXE3Q13461 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
FOXE3Q13461 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
FOXE3Q13461 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
FOXE3Q13461 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
FOXE3Q13461 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
FOXE3Q13461 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
FOXE3Q13461 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
FOXE3Q13461 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
FOXE3Q13461 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
FOXE3Q13461 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
FOXE3Q13461 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
FOXE3Q13461 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
FOXE3Q13461 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
FOXE3Q13461 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
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