Protein–RNA interactions for Protein: Q13421

MSLN, Mesothelin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 630 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MSLNQ13421 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
MSLNQ13421 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
MSLNQ13421 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
MSLNQ13421 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
MSLNQ13421 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
MSLNQ13421 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
MSLNQ13421 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
MSLNQ13421 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
MSLNQ13421 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
MSLNQ13421 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
MSLNQ13421 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
MSLNQ13421 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
MSLNQ13421 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
MSLNQ13421 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
MSLNQ13421 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
MSLNQ13421 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
MSLNQ13421 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
MSLNQ13421 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
MSLNQ13421 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
MSLNQ13421 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
MSLNQ13421 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
MSLNQ13421 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
MSLNQ13421 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
MSLNQ13421 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
MSLNQ13421 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
MSLNQ13421 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
MSLNQ13421 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
MSLNQ13421 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
MSLNQ13421 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
MSLNQ13421 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
MSLNQ13421 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
MSLNQ13421 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
MSLNQ13421 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
MSLNQ13421 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
MSLNQ13421 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
MSLNQ13421 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
MSLNQ13421 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
MSLNQ13421 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
MSLNQ13421 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
MSLNQ13421 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
MSLNQ13421 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
MSLNQ13421 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
MSLNQ13421 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
MSLNQ13421 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
MSLNQ13421 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
MSLNQ13421 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
MSLNQ13421 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
MSLNQ13421 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
MSLNQ13421 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
MSLNQ13421 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
MSLNQ13421 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
MSLNQ13421 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
MSLNQ13421 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
MSLNQ13421 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
MSLNQ13421 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
MSLNQ13421 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
MSLNQ13421 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
MSLNQ13421 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
MSLNQ13421 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.07
MSLNQ13421 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
MSLNQ13421 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
MSLNQ13421 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
MSLNQ13421 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
MSLNQ13421 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
MSLNQ13421 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC21.7■■□□□ 1.06
MSLNQ13421 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
MSLNQ13421 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
MSLNQ13421 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
MSLNQ13421 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
MSLNQ13421 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
MSLNQ13421 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
MSLNQ13421 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
MSLNQ13421 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
MSLNQ13421 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
MSLNQ13421 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
MSLNQ13421 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
MSLNQ13421 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
MSLNQ13421 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
MSLNQ13421 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
MSLNQ13421 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
MSLNQ13421 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
MSLNQ13421 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
MSLNQ13421 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
MSLNQ13421 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
MSLNQ13421 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
MSLNQ13421 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
MSLNQ13421 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
MSLNQ13421 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
MSLNQ13421 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
MSLNQ13421 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
MSLNQ13421 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
MSLNQ13421 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
MSLNQ13421 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
MSLNQ13421 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
MSLNQ13421 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
MSLNQ13421 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
MSLNQ13421 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
MSLNQ13421 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
MSLNQ13421 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
MSLNQ13421 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
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