Protein–RNA interactions for Protein: Q13351

KLF1, Krueppel-like factor 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 362 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLF1Q13351 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
KLF1Q13351 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
KLF1Q13351 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
KLF1Q13351 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
KLF1Q13351 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
KLF1Q13351 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
KLF1Q13351 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
KLF1Q13351 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
KLF1Q13351 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
KLF1Q13351 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
KLF1Q13351 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
KLF1Q13351 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
KLF1Q13351 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
KLF1Q13351 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
KLF1Q13351 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
KLF1Q13351 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
KLF1Q13351 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
KLF1Q13351 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
KLF1Q13351 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
KLF1Q13351 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
KLF1Q13351 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
KLF1Q13351 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
KLF1Q13351 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
KLF1Q13351 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
KLF1Q13351 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
KLF1Q13351 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
KLF1Q13351 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
KLF1Q13351 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
KLF1Q13351 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
KLF1Q13351 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
KLF1Q13351 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
KLF1Q13351 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
KLF1Q13351 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
KLF1Q13351 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
KLF1Q13351 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
KLF1Q13351 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
KLF1Q13351 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
KLF1Q13351 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
KLF1Q13351 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
KLF1Q13351 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
KLF1Q13351 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
KLF1Q13351 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
KLF1Q13351 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
KLF1Q13351 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
KLF1Q13351 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
KLF1Q13351 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
KLF1Q13351 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
KLF1Q13351 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
KLF1Q13351 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
KLF1Q13351 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
KLF1Q13351 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
KLF1Q13351 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
KLF1Q13351 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
KLF1Q13351 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
KLF1Q13351 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
KLF1Q13351 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
KLF1Q13351 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
KLF1Q13351 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
KLF1Q13351 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
KLF1Q13351 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
KLF1Q13351 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
KLF1Q13351 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
KLF1Q13351 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
KLF1Q13351 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
KLF1Q13351 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
KLF1Q13351 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
KLF1Q13351 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
KLF1Q13351 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
KLF1Q13351 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
KLF1Q13351 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
KLF1Q13351 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
KLF1Q13351 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
KLF1Q13351 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
KLF1Q13351 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
KLF1Q13351 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
KLF1Q13351 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
KLF1Q13351 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
KLF1Q13351 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
KLF1Q13351 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
KLF1Q13351 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
KLF1Q13351 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
KLF1Q13351 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
KLF1Q13351 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
KLF1Q13351 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
KLF1Q13351 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
KLF1Q13351 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
KLF1Q13351 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
KLF1Q13351 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
KLF1Q13351 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
KLF1Q13351 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
KLF1Q13351 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
KLF1Q13351 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
KLF1Q13351 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
KLF1Q13351 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
KLF1Q13351 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
KLF1Q13351 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
KLF1Q13351 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
KLF1Q13351 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
KLF1Q13351 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
KLF1Q13351 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
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