Protein–RNA interactions for Protein: Q12999

TSPAN31, Tetraspanin-31, humanhuman

Predictions only

Length 210 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSPAN31Q12999 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TSPAN31Q12999 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
TSPAN31Q12999 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
TSPAN31Q12999 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
TSPAN31Q12999 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
TSPAN31Q12999 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
TSPAN31Q12999 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
TSPAN31Q12999 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
TSPAN31Q12999 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
TSPAN31Q12999 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
TSPAN31Q12999 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
TSPAN31Q12999 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
TSPAN31Q12999 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
TSPAN31Q12999 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
TSPAN31Q12999 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
TSPAN31Q12999 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
TSPAN31Q12999 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
TSPAN31Q12999 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
TSPAN31Q12999 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
TSPAN31Q12999 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
TSPAN31Q12999 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
TSPAN31Q12999 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
TSPAN31Q12999 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
TSPAN31Q12999 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
TSPAN31Q12999 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
TSPAN31Q12999 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
TSPAN31Q12999 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
TSPAN31Q12999 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
TSPAN31Q12999 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
TSPAN31Q12999 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
TSPAN31Q12999 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
TSPAN31Q12999 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
TSPAN31Q12999 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
TSPAN31Q12999 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
TSPAN31Q12999 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
TSPAN31Q12999 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
TSPAN31Q12999 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
TSPAN31Q12999 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
TSPAN31Q12999 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
TSPAN31Q12999 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
TSPAN31Q12999 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
TSPAN31Q12999 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
TSPAN31Q12999 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
TSPAN31Q12999 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
TSPAN31Q12999 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
TSPAN31Q12999 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
TSPAN31Q12999 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
TSPAN31Q12999 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
TSPAN31Q12999 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC19.45■□□□□ 0.7
TSPAN31Q12999 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
TSPAN31Q12999 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
TSPAN31Q12999 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
TSPAN31Q12999 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
TSPAN31Q12999 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
TSPAN31Q12999 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
TSPAN31Q12999 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
TSPAN31Q12999 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
TSPAN31Q12999 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
TSPAN31Q12999 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
TSPAN31Q12999 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
TSPAN31Q12999 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
TSPAN31Q12999 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
TSPAN31Q12999 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
TSPAN31Q12999 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
TSPAN31Q12999 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
TSPAN31Q12999 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
TSPAN31Q12999 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
TSPAN31Q12999 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
TSPAN31Q12999 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
TSPAN31Q12999 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
TSPAN31Q12999 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
TSPAN31Q12999 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
TSPAN31Q12999 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
TSPAN31Q12999 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
TSPAN31Q12999 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
TSPAN31Q12999 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
TSPAN31Q12999 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
TSPAN31Q12999 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
TSPAN31Q12999 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
TSPAN31Q12999 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
TSPAN31Q12999 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
TSPAN31Q12999 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
TSPAN31Q12999 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
TSPAN31Q12999 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
TSPAN31Q12999 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
TSPAN31Q12999 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC19.43■□□□□ 0.7
TSPAN31Q12999 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
TSPAN31Q12999 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC19.43■□□□□ 0.7
TSPAN31Q12999 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
TSPAN31Q12999 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
TSPAN31Q12999 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
TSPAN31Q12999 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
TSPAN31Q12999 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
TSPAN31Q12999 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
TSPAN31Q12999 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
TSPAN31Q12999 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
TSPAN31Q12999 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC19.43■□□□□ 0.7
TSPAN31Q12999 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
TSPAN31Q12999 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
TSPAN31Q12999 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.6 ms