Protein–RNA interactions for Protein: Q12986

NFX1, Transcriptional repressor NF-X1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,120 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFX1Q12986 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
NFX1Q12986 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
NFX1Q12986 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
NFX1Q12986 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
NFX1Q12986 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
NFX1Q12986 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.38
NFX1Q12986 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
NFX1Q12986 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
NFX1Q12986 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
NFX1Q12986 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
NFX1Q12986 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
NFX1Q12986 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
NFX1Q12986 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
NFX1Q12986 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
NFX1Q12986 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
NFX1Q12986 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
NFX1Q12986 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
NFX1Q12986 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
NFX1Q12986 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
NFX1Q12986 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
NFX1Q12986 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
NFX1Q12986 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
NFX1Q12986 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
NFX1Q12986 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
NFX1Q12986 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
NFX1Q12986 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
NFX1Q12986 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
NFX1Q12986 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
NFX1Q12986 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
NFX1Q12986 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
NFX1Q12986 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
NFX1Q12986 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
NFX1Q12986 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
NFX1Q12986 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC23.62■■□□□ 1.37
NFX1Q12986 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
NFX1Q12986 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
NFX1Q12986 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
NFX1Q12986 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
NFX1Q12986 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
NFX1Q12986 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
NFX1Q12986 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
NFX1Q12986 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
NFX1Q12986 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
NFX1Q12986 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
NFX1Q12986 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
NFX1Q12986 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
NFX1Q12986 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
NFX1Q12986 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
NFX1Q12986 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
NFX1Q12986 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
NFX1Q12986 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
NFX1Q12986 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
NFX1Q12986 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
NFX1Q12986 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
NFX1Q12986 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
NFX1Q12986 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
NFX1Q12986 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
NFX1Q12986 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
NFX1Q12986 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
NFX1Q12986 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
NFX1Q12986 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
NFX1Q12986 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
NFX1Q12986 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
NFX1Q12986 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
NFX1Q12986 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
NFX1Q12986 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
NFX1Q12986 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
NFX1Q12986 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
NFX1Q12986 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
NFX1Q12986 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
NFX1Q12986 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
NFX1Q12986 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
NFX1Q12986 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
NFX1Q12986 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
NFX1Q12986 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
NFX1Q12986 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC23.58■■□□□ 1.37
NFX1Q12986 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
NFX1Q12986 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
NFX1Q12986 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC23.58■■□□□ 1.37
NFX1Q12986 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
NFX1Q12986 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
NFX1Q12986 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
NFX1Q12986 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
NFX1Q12986 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
NFX1Q12986 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
NFX1Q12986 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
NFX1Q12986 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
NFX1Q12986 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
NFX1Q12986 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
NFX1Q12986 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
NFX1Q12986 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
NFX1Q12986 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
NFX1Q12986 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
NFX1Q12986 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
NFX1Q12986 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
NFX1Q12986 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
NFX1Q12986 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
NFX1Q12986 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
NFX1Q12986 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
NFX1Q12986 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
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