Protein–RNA interactions for Protein: Q12948

FOXC1, Forkhead box protein C1, humanhuman

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Length 553 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXC1Q12948 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
FOXC1Q12948 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
FOXC1Q12948 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
FOXC1Q12948 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
FOXC1Q12948 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
FOXC1Q12948 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
FOXC1Q12948 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
FOXC1Q12948 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
FOXC1Q12948 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
FOXC1Q12948 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
FOXC1Q12948 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
FOXC1Q12948 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
FOXC1Q12948 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
FOXC1Q12948 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
FOXC1Q12948 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
FOXC1Q12948 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
FOXC1Q12948 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
FOXC1Q12948 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
FOXC1Q12948 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
FOXC1Q12948 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
FOXC1Q12948 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
FOXC1Q12948 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
FOXC1Q12948 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
FOXC1Q12948 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
FOXC1Q12948 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
FOXC1Q12948 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
FOXC1Q12948 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
FOXC1Q12948 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
FOXC1Q12948 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
FOXC1Q12948 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
FOXC1Q12948 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
FOXC1Q12948 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
FOXC1Q12948 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
FOXC1Q12948 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
FOXC1Q12948 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
FOXC1Q12948 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
FOXC1Q12948 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
FOXC1Q12948 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
FOXC1Q12948 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
FOXC1Q12948 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
FOXC1Q12948 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
FOXC1Q12948 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
FOXC1Q12948 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC20.52■□□□□ 0.88
FOXC1Q12948 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
FOXC1Q12948 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
FOXC1Q12948 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.87
FOXC1Q12948 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
FOXC1Q12948 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
FOXC1Q12948 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC20.51■□□□□ 0.87
FOXC1Q12948 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
FOXC1Q12948 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
FOXC1Q12948 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
FOXC1Q12948 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
FOXC1Q12948 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
FOXC1Q12948 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
FOXC1Q12948 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
FOXC1Q12948 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
FOXC1Q12948 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
FOXC1Q12948 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
FOXC1Q12948 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
FOXC1Q12948 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
FOXC1Q12948 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
FOXC1Q12948 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
FOXC1Q12948 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
FOXC1Q12948 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
FOXC1Q12948 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
FOXC1Q12948 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
FOXC1Q12948 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
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FOXC1Q12948 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
FOXC1Q12948 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
FOXC1Q12948 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
FOXC1Q12948 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
FOXC1Q12948 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
FOXC1Q12948 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
FOXC1Q12948 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
FOXC1Q12948 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
FOXC1Q12948 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
FOXC1Q12948 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
FOXC1Q12948 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
FOXC1Q12948 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
FOXC1Q12948 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
FOXC1Q12948 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
FOXC1Q12948 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
FOXC1Q12948 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
FOXC1Q12948 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
FOXC1Q12948 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
FOXC1Q12948 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
FOXC1Q12948 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
FOXC1Q12948 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
FOXC1Q12948 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
FOXC1Q12948 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
FOXC1Q12948 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
FOXC1Q12948 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
FOXC1Q12948 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
FOXC1Q12948 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
FOXC1Q12948 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
FOXC1Q12948 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
FOXC1Q12948 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
FOXC1Q12948 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
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