Protein–RNA interactions for Protein: Q12766

HMGXB3, HMG domain-containing protein 3, humanhuman

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Length 1,538 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMGXB3Q12766 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC38.46■■■■□ 3.75
HMGXB3Q12766 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC38.46■■■■□ 3.75
HMGXB3Q12766 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.46■■■■□ 3.75
HMGXB3Q12766 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.45■■■■□ 3.75
HMGXB3Q12766 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC38.45■■■■□ 3.75
HMGXB3Q12766 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC38.45■■■■□ 3.75
HMGXB3Q12766 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC38.45■■■■□ 3.75
HMGXB3Q12766 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC38.45■■■■□ 3.75
HMGXB3Q12766 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC38.44■■■■□ 3.74
HMGXB3Q12766 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.44■■■■□ 3.74
HMGXB3Q12766 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.44■■■■□ 3.74
HMGXB3Q12766 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.44■■■■□ 3.74
HMGXB3Q12766 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC38.44■■■■□ 3.74
HMGXB3Q12766 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.44■■■■□ 3.74
HMGXB3Q12766 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC38.44■■■■□ 3.74
HMGXB3Q12766 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.43■■■■□ 3.74
HMGXB3Q12766 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.43■■■■□ 3.74
HMGXB3Q12766 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.43■■■■□ 3.74
HMGXB3Q12766 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC38.43■■■■□ 3.74
HMGXB3Q12766 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC38.43■■■■□ 3.74
HMGXB3Q12766 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.43■■■■□ 3.74
HMGXB3Q12766 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC38.43■■■■□ 3.74
HMGXB3Q12766 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.42■■■■□ 3.74
HMGXB3Q12766 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC38.42■■■■□ 3.74
HMGXB3Q12766 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC38.42■■■■□ 3.74
HMGXB3Q12766 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC38.41■■■■□ 3.74
HMGXB3Q12766 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC38.41■■■■□ 3.74
HMGXB3Q12766 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.41■■■■□ 3.74
HMGXB3Q12766 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.41■■■■□ 3.74
HMGXB3Q12766 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC38.41■■■■□ 3.74
HMGXB3Q12766 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC38.41■■■■□ 3.74
HMGXB3Q12766 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.41■■■■□ 3.74
HMGXB3Q12766 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC38.4■■■■□ 3.74
HMGXB3Q12766 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.4■■■■□ 3.74
HMGXB3Q12766 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC38.4■■■■□ 3.74
HMGXB3Q12766 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.4■■■■□ 3.74
HMGXB3Q12766 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC38.4■■■■□ 3.74
HMGXB3Q12766 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.4■■■■□ 3.74
HMGXB3Q12766 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC38.4■■■■□ 3.74
HMGXB3Q12766 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC38.4■■■■□ 3.74
HMGXB3Q12766 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC38.4■■■■□ 3.74
HMGXB3Q12766 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC38.4■■■■□ 3.74
HMGXB3Q12766 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC38.39■■■■□ 3.74
HMGXB3Q12766 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC38.39■■■■□ 3.74
HMGXB3Q12766 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.39■■■■□ 3.74
HMGXB3Q12766 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC38.39■■■■□ 3.74
HMGXB3Q12766 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC38.39■■■■□ 3.74
HMGXB3Q12766 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC38.39■■■■□ 3.74
HMGXB3Q12766 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC38.39■■■■□ 3.74
HMGXB3Q12766 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC38.39■■■■□ 3.74
HMGXB3Q12766 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.39■■■■□ 3.74
HMGXB3Q12766 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.38■■■■□ 3.74
HMGXB3Q12766 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.38■■■■□ 3.74
HMGXB3Q12766 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC38.38■■■■□ 3.74
HMGXB3Q12766 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC38.38■■■■□ 3.74
HMGXB3Q12766 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC38.38■■■■□ 3.74
HMGXB3Q12766 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC38.38■■■■□ 3.74
HMGXB3Q12766 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.38■■■■□ 3.74
HMGXB3Q12766 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC38.38■■■■□ 3.73
HMGXB3Q12766 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.38■■■■□ 3.73
HMGXB3Q12766 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.38■■■■□ 3.73
HMGXB3Q12766 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC38.38■■■■□ 3.73
HMGXB3Q12766 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC38.37■■■■□ 3.73
HMGXB3Q12766 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC38.37■■■■□ 3.73
HMGXB3Q12766 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.37■■■■□ 3.73
HMGXB3Q12766 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC38.37■■■■□ 3.73
HMGXB3Q12766 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC38.37■■■■□ 3.73
HMGXB3Q12766 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC38.37■■■■□ 3.73
HMGXB3Q12766 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC38.37■■■■□ 3.73
HMGXB3Q12766 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC38.37■■■■□ 3.73
HMGXB3Q12766 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC38.37■■■■□ 3.73
HMGXB3Q12766 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC38.37■■■■□ 3.73
HMGXB3Q12766 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC38.36■■■■□ 3.73
HMGXB3Q12766 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC38.36■■■■□ 3.73
HMGXB3Q12766 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC38.36■■■■□ 3.73
HMGXB3Q12766 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC38.36■■■■□ 3.73
HMGXB3Q12766 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.35■■■■□ 3.73
HMGXB3Q12766 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.35■■■■□ 3.73
HMGXB3Q12766 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC38.35■■■■□ 3.73
HMGXB3Q12766 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC38.35■■■■□ 3.73
HMGXB3Q12766 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.35■■■■□ 3.73
HMGXB3Q12766 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC38.34■■■■□ 3.73
HMGXB3Q12766 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC38.34■■■■□ 3.73
HMGXB3Q12766 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.34■■■■□ 3.73
HMGXB3Q12766 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.34■■■■□ 3.73
HMGXB3Q12766 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.34■■■■□ 3.73
HMGXB3Q12766 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.34■■■■□ 3.73
HMGXB3Q12766 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC38.33■■■■□ 3.73
HMGXB3Q12766 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.33■■■■□ 3.73
HMGXB3Q12766 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.33■■■■□ 3.73
HMGXB3Q12766 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.33■■■■□ 3.73
HMGXB3Q12766 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.33■■■■□ 3.73
HMGXB3Q12766 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC38.33■■■■□ 3.73
HMGXB3Q12766 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.33■■■■□ 3.73
HMGXB3Q12766 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC38.33■■■■□ 3.73
HMGXB3Q12766 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.33■■■■□ 3.73
HMGXB3Q12766 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.33■■■■□ 3.73
HMGXB3Q12766 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.33■■■■□ 3.73
HMGXB3Q12766 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC38.33■■■■□ 3.73
HMGXB3Q12766 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC38.33■■■■□ 3.73
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