Protein–RNA interactions for Protein: Q12217

TY1A-BR, Transposon Ty1-BR Gag polyprotein, yeastyeast

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Length 440 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
TY1A-BRQ12217 YGL152CYGL152C 678 nt5.97□□□□□ -1.45
TY1A-BRQ12217 PUP2YGR253C 783 nt5.97□□□□□ -1.45
TY1A-BRQ12217 YIR042CYIR042C 711 nt5.97□□□□□ -1.45
TY1A-BRQ12217 YJL015CYJL015C 285 nt5.97□□□□□ -1.45
TY1A-BRQ12217 YLR466C-BYLR466C-B 117 nt5.97□□□□□ -1.45
TY1A-BRQ12217 YNL150WYNL150W 408 nt5.97□□□□□ -1.45
TY1A-BRQ12217 YNL184CYNL184C 327 nt5.97□□□□□ -1.45
TY1A-BRQ12217 YPR099CYPR099C 357 nt5.97□□□□□ -1.45
TY1A-BRQ12217 ERG4YGL012W 1422 nt5.97□□□□□ -1.45
TY1A-BRQ12217 ANR2YKL047W 1551 nt5.97□□□□□ -1.45
TY1A-BRQ12217 GNT1YOR320C 1476 nt5.96□□□□□ -1.45
TY1A-BRQ12217 MHP1YJL042W 4197 nt5.96□□□□□ -1.46
TY1A-BRQ12217 HED1YDR014W-A 489 nt5.96□□□□□ -1.46
TY1A-BRQ12217 ERV1YGR029W 570 nt5.96□□□□□ -1.46
TY1A-BRQ12217 DPH1YIL103W 1278 nt5.96□□□□□ -1.46
TY1A-BRQ12217 CSE4YKL049C 690 nt5.96□□□□□ -1.46
TY1A-BRQ12217 snR24snR24 89 nt5.96□□□□□ -1.46
TY1A-BRQ12217 YML096WYML096W 1578 nt5.96□□□□□ -1.46
TY1A-BRQ12217 NAF1YNL124W 1479 nt5.96□□□□□ -1.46
TY1A-BRQ12217 SSF2YDR312W 1362 nt5.95□□□□□ -1.46
TY1A-BRQ12217 STE5YDR103W 2754 nt5.95□□□□□ -1.46
TY1A-BRQ12217 TDA2YER071C 381 nt5.95□□□□□ -1.46
TY1A-BRQ12217 RPL8AYHL033C 771 nt5.95□□□□□ -1.46
TY1A-BRQ12217 CRG1YHR209W 876 nt5.95□□□□□ -1.46
TY1A-BRQ12217 YBR232CYBR232C 360 nt5.95□□□□□ -1.46
TY1A-BRQ12217 UBX2YML013W 1755 nt5.95□□□□□ -1.46
TY1A-BRQ12217 MSE1YOL033W 1611 nt5.95□□□□□ -1.46
TY1A-BRQ12217 SMF2YHR050W 1650 nt5.94□□□□□ -1.46
TY1A-BRQ12217 RFA1YAR007C 1866 nt5.94□□□□□ -1.46
TY1A-BRQ12217 YCK3YER123W 1575 nt5.94□□□□□ -1.46
TY1A-BRQ12217 ADY2YCR010C 852 nt5.94□□□□□ -1.46
TY1A-BRQ12217 YCR101CYCR101C 549 nt5.94□□□□□ -1.46
TY1A-BRQ12217 ARF2YDL137W 546 nt5.94□□□□□ -1.46
TY1A-BRQ12217 YIR020CYIR020C 303 nt5.94□□□□□ -1.46
TY1A-BRQ12217 YLR031WYLR031W 561 nt5.94□□□□□ -1.46
TY1A-BRQ12217 YML018CYML018C 1182 nt5.94□□□□□ -1.46
TY1A-BRQ12217 TAF14YPL129W 735 nt5.94□□□□□ -1.46
TY1A-BRQ12217 SKI2YLR398C 3864 nt5.94□□□□□ -1.46
TY1A-BRQ12217 HRR25YPL204W 1485 nt5.94□□□□□ -1.46
TY1A-BRQ12217 ARB1YER036C 1833 nt5.94□□□□□ -1.46
TY1A-BRQ12217 CHA4YLR098C 1947 nt5.93□□□□□ -1.46
TY1A-BRQ12217 EMW1YNL313C 2715 nt5.93□□□□□ -1.46
TY1A-BRQ12217 ASI3YNL008C 2031 nt5.93□□□□□ -1.46
TY1A-BRQ12217 YER038W-AYER038W-A 381 nt5.93□□□□□ -1.46
TY1A-BRQ12217 CIS3YJL158C 684 nt5.93□□□□□ -1.46
TY1A-BRQ12217 RPL17BYJL177W 555 nt5.93□□□□□ -1.46
TY1A-BRQ12217 UTP11YKL099C 753 nt5.93□□□□□ -1.46
TY1A-BRQ12217 SMA2YML066C 1110 nt5.93□□□□□ -1.46
TY1A-BRQ12217 ISF1YMR081C 1017 nt5.93□□□□□ -1.46
TY1A-BRQ12217 YBR032WYBR032W 303 nt5.93□□□□□ -1.46
TY1A-BRQ12217 SUB2YDL084W 1341 nt5.93□□□□□ -1.46
TY1A-BRQ12217 YBR012W-AYBR012W-A 1323 nt5.93□□□□□ -1.46
TY1A-BRQ12217 YOR142W-AYOR142W-A 1323 nt5.93□□□□□ -1.46
TY1A-BRQ12217 YPR158W-AYPR158W-A 1323 nt5.93□□□□□ -1.46
TY1A-BRQ12217 GPB1YOR371C 2694 nt5.92□□□□□ -1.46
TY1A-BRQ12217 MDL1YLR188W 2088 nt5.92□□□□□ -1.46
TY1A-BRQ12217 UTP9YHR196W 1728 nt5.92□□□□□ -1.46
TY1A-BRQ12217 GCS1YDL226C 1059 nt5.92□□□□□ -1.46
TY1A-BRQ12217 TFB3YDR460W 966 nt5.92□□□□□ -1.46
TY1A-BRQ12217 RSM25YIL093C 795 nt5.92□□□□□ -1.46
TY1A-BRQ12217 RDN5-2RDN5-2 119 nt5.92□□□□□ -1.46
TY1A-BRQ12217 RDN5-3RDN5-3 119 nt5.92□□□□□ -1.46
TY1A-BRQ12217 RDN5-4RDN5-4 119 nt5.92□□□□□ -1.46
TY1A-BRQ12217 RDN5-5RDN5-5 119 nt5.92□□□□□ -1.46
TY1A-BRQ12217 SUP35YDR172W 2058 nt5.92□□□□□ -1.46
TY1A-BRQ12217 VPS33YLR396C 2076 nt5.92□□□□□ -1.46
TY1A-BRQ12217 POP1YNL221C 2628 nt5.91□□□□□ -1.46
TY1A-BRQ12217 SAE2YGL175C 1038 nt5.91□□□□□ -1.46
TY1A-BRQ12217 VTI1YMR197C 654 nt5.91□□□□□ -1.46
TY1A-BRQ12217 YMR307C-AYMR307C-A 195 nt5.91□□□□□ -1.46
TY1A-BRQ12217 HEM4YOR278W 828 nt5.91□□□□□ -1.46
TY1A-BRQ12217 RDL2YOR286W 450 nt5.91□□□□□ -1.46
TY1A-BRQ12217 CAM1YPL048W 1248 nt5.91□□□□□ -1.46
TY1A-BRQ12217 YPL135C-AYPL135C-A 174 nt5.91□□□□□ -1.46
TY1A-BRQ12217 VHR1YIL056W 1923 nt5.91□□□□□ -1.46
TY1A-BRQ12217 NGL3YML118W 1518 nt5.9□□□□□ -1.46
TY1A-BRQ12217 YIL055CYIL055C 1884 nt5.9□□□□□ -1.46
TY1A-BRQ12217 YER079C-AYER079C-A 339 nt5.9□□□□□ -1.46
TY1A-BRQ12217 VOA1YGR106C 798 nt5.9□□□□□ -1.46
TY1A-BRQ12217 RNR4YGR180C 1038 nt5.9□□□□□ -1.46
TY1A-BRQ12217 BET5YML077W 480 nt5.9□□□□□ -1.46
TY1A-BRQ12217 RAD14YMR201C 1116 nt5.9□□□□□ -1.46
TY1A-BRQ12217 INN1YNL152W 1230 nt5.9□□□□□ -1.46
TY1A-BRQ12217 NRM1YNR009W 750 nt5.9□□□□□ -1.46
TY1A-BRQ12217 YPL107WYPL107W 747 nt5.9□□□□□ -1.46
TY1A-BRQ12217 DER1YBR201W 636 nt5.9□□□□□ -1.46
TY1A-BRQ12217 IMA5YJL216C 1746 nt5.9□□□□□ -1.47
TY1A-BRQ12217 NTH1YDR001C 2256 nt5.9□□□□□ -1.47
TY1A-BRQ12217 PAC2YER007W 1557 nt5.89□□□□□ -1.47
TY1A-BRQ12217 APS3YJL024C 585 nt5.89□□□□□ -1.47
TY1A-BRQ12217 YKL107WYKL107W 930 nt5.89□□□□□ -1.47
TY1A-BRQ12217 NOP15YNL110C 663 nt5.89□□□□□ -1.47
TY1A-BRQ12217 RPL18AYOL120C 561 nt5.89□□□□□ -1.47
TY1A-BRQ12217 CDC33YOL139C 642 nt5.89□□□□□ -1.47
TY1A-BRQ12217 YPL152W-AYPL152W-A 99 nt5.89□□□□□ -1.47
TY1A-BRQ12217 PTK2YJR059W 2457 nt5.89□□□□□ -1.47
TY1A-BRQ12217 BFR1YOR198C 1413 nt5.89□□□□□ -1.47
TY1A-BRQ12217 ATP2YJR121W 1536 nt5.89□□□□□ -1.47
TY1A-BRQ12217 YDL009CYDL009C 324 nt5.88□□□□□ -1.47
TY1A-BRQ12217 SUF3tG(CCC)D 72 nt5.88□□□□□ -1.47
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