Protein–RNA interactions for Protein: Q12208

USB1, U6 snRNA phosphodiesterase, yeastyeast

Known RBP Predictions only

Length 290 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
USB1Q12208 RPS23BYPR132W 438 nt2.85□□□□□ -1.95
USB1Q12208 TIF4631YGR162W 2859 nt2.85□□□□□ -1.95
USB1Q12208 CEX1YOR112W 2286 nt2.85□□□□□ -1.95
USB1Q12208 ALG8YOR067C 1734 nt2.85□□□□□ -1.95
USB1Q12208 BUD4YJR092W 4344 nt2.84□□□□□ -1.95
USB1Q12208 YER165C-AYER165C-A 357 nt2.84□□□□□ -1.95
USB1Q12208 RPS21BYJL136C 264 nt2.84□□□□□ -1.95
USB1Q12208 LTO1YNL260C 597 nt2.84□□□□□ -1.95
USB1Q12208 AIM41YOR215C 558 nt2.84□□□□□ -1.95
USB1Q12208 YBR053CYBR053C 1077 nt2.84□□□□□ -1.95
USB1Q12208 USV1YPL230W 1176 nt2.84□□□□□ -1.95
USB1Q12208 YBR089WYBR089W 600 nt2.84□□□□□ -1.95
USB1Q12208 CDH1YGL003C 1701 nt2.84□□□□□ -1.96
USB1Q12208 GLC3YEL011W 2115 nt2.84□□□□□ -1.96
USB1Q12208 RPA190YOR341W 4995 nt2.84□□□□□ -1.96
USB1Q12208 MEF1YLR069C 2286 nt2.83□□□□□ -1.96
USB1Q12208 YDR161WYDR161W 1164 nt2.83□□□□□ -1.96
USB1Q12208 MMS21YEL019C 804 nt2.83□□□□□ -1.96
USB1Q12208 YER147C-AYER147C-A 411 nt2.83□□□□□ -1.96
USB1Q12208 YFL041W-AYFL041W-A 192 nt2.83□□□□□ -1.96
USB1Q12208 SPC3YLR066W 555 nt2.83□□□□□ -1.96
USB1Q12208 COQ9YLR201C 783 nt2.83□□□□□ -1.96
USB1Q12208 HPA2YPR193C 471 nt2.83□□□□□ -1.96
USB1Q12208 CMD1YBR109C 444 nt2.83□□□□□ -1.96
USB1Q12208 YNR063WYNR063W 1824 nt2.83□□□□□ -1.96
USB1Q12208 MTR4YJL050W 3222 nt2.83□□□□□ -1.96
USB1Q12208 SPO71YDR104C 3738 nt2.82□□□□□ -1.96
USB1Q12208 AEP2YMR282C 1743 nt2.82□□□□□ -1.96
USB1Q12208 CHA4YLR098C 1947 nt2.82□□□□□ -1.96
USB1Q12208 NDC80YIL144W 2076 nt2.82□□□□□ -1.96
USB1Q12208 YDR090CYDR090C 933 nt2.82□□□□□ -1.96
USB1Q12208 ERG26YGL001C 1050 nt2.82□□□□□ -1.96
USB1Q12208 EMG1YLR186W 759 nt2.82□□□□□ -1.96
USB1Q12208 INN1YNL152W 1230 nt2.82□□□□□ -1.96
USB1Q12208 CYC2YOR037W 1101 nt2.82□□□□□ -1.96
USB1Q12208 DSE3YOR264W 1293 nt2.82□□□□□ -1.96
USB1Q12208 MIF2YKL089W 1650 nt2.82□□□□□ -1.96
USB1Q12208 EXO5YBR163W 1758 nt2.82□□□□□ -1.96
USB1Q12208 YEL025CYEL025C 3567 nt2.81□□□□□ -1.96
USB1Q12208 SNQ2YDR011W 4506 nt2.81□□□□□ -1.96
USB1Q12208 RTN1YDR233C 888 nt2.81□□□□□ -1.96
USB1Q12208 TAM41YGR046W 1158 nt2.81□□□□□ -1.96
USB1Q12208 YAL064W-BYAL064W-B 381 nt2.81□□□□□ -1.96
USB1Q12208 PBA1YLR199C 831 nt2.81□□□□□ -1.96
USB1Q12208 GOT1YMR292W 417 nt2.81□□□□□ -1.96
USB1Q12208 AIM39YOL053W 1188 nt2.81□□□□□ -1.96
USB1Q12208 TAF14YPL129W 735 nt2.81□□□□□ -1.96
USB1Q12208 VPS17YOR132W 1656 nt2.81□□□□□ -1.96
USB1Q12208 SPO14YKR031C 5052 nt2.81□□□□□ -1.96
USB1Q12208 MIT1YEL007W 2001 nt2.8□□□□□ -1.96
USB1Q12208 YDL180WYDL180W 1644 nt2.8□□□□□ -1.96
USB1Q12208 CTK1YKL139W 1587 nt2.8□□□□□ -1.96
USB1Q12208 XRN1YGL173C 4587 nt2.8□□□□□ -1.96
USB1Q12208 SHQ1YIL104C 1524 nt2.8□□□□□ -1.96
USB1Q12208 GTT1YIR038C 705 nt2.8□□□□□ -1.96
USB1Q12208 YLR416CYLR416C 399 nt2.8□□□□□ -1.96
USB1Q12208 RHO5YNL180C 996 nt2.8□□□□□ -1.96
USB1Q12208 YOL019W-AYOL019W-A 153 nt2.8□□□□□ -1.96
USB1Q12208 MDV1YJL112W 2145 nt2.8□□□□□ -1.96
USB1Q12208 YGR026WYGR026W 837 nt2.79□□□□□ -1.96
USB1Q12208 DLS1YJL065C 504 nt2.79□□□□□ -1.96
USB1Q12208 RPS21AYKR057W 264 nt2.79□□□□□ -1.96
USB1Q12208 YPR136CYPR136C 513 nt2.79□□□□□ -1.96
USB1Q12208 POL2YNL262W 6669 nt2.79□□□□□ -1.96
USB1Q12208 DBP5YOR046C 1449 nt2.78□□□□□ -1.96
USB1Q12208 ROM1YGR070W 3468 nt2.78□□□□□ -1.96
USB1Q12208 YPR148CYPR148C 1308 nt2.78□□□□□ -1.96
USB1Q12208 VBA4YDR119W 2307 nt2.78□□□□□ -1.96
USB1Q12208 RPS29BYDL061C 171 nt2.78□□□□□ -1.96
USB1Q12208 TGL2YDR058C 981 nt2.78□□□□□ -1.96
USB1Q12208 RRP8YDR083W 1179 nt2.78□□□□□ -1.96
USB1Q12208 LSM6YDR378C 261 nt2.78□□□□□ -1.96
USB1Q12208 YDR442WYDR442W 393 nt2.78□□□□□ -1.96
USB1Q12208 KXD1YGL079W 657 nt2.78□□□□□ -1.96
USB1Q12208 SDP1YIL113W 630 nt2.78□□□□□ -1.96
USB1Q12208 RPL17AYKL180W 555 nt2.78□□□□□ -1.96
USB1Q12208 ERG2YMR202W 669 nt2.78□□□□□ -1.96
USB1Q12208 PPA2YMR267W 933 nt2.78□□□□□ -1.96
USB1Q12208 RAS1YOR101W 930 nt2.78□□□□□ -1.96
USB1Q12208 MRPL51YPR100W 423 nt2.78□□□□□ -1.96
USB1Q12208 BMT2YBR141C 1014 nt2.78□□□□□ -1.96
USB1Q12208 TSC11YER093C 4293 nt2.78□□□□□ -1.96
USB1Q12208 DYN1YKR054C 12279 nt2.78□□□□□ -1.96
USB1Q12208 SDS23YGL056C 1584 nt2.78□□□□□ -1.96
USB1Q12208 UBP5YER144C 2418 nt2.78□□□□□ -1.97
USB1Q12208 EBS1YDR206W 2655 nt2.77□□□□□ -1.97
USB1Q12208 YMR317WYMR317W 3423 nt2.77□□□□□ -1.97
USB1Q12208 MYO5YMR109W 3660 nt2.77□□□□□ -1.97
USB1Q12208 HRD1YOL013C 1656 nt2.77□□□□□ -1.97
USB1Q12208 OPI6YDL096C 327 nt2.77□□□□□ -1.97
USB1Q12208 USE1YGL098W 738 nt2.77□□□□□ -1.97
USB1Q12208 HHF1YBR009C 312 nt2.77□□□□□ -1.97
USB1Q12208 YOR314WYOR314W 330 nt2.77□□□□□ -1.97
USB1Q12208 NIP7YPL211W 546 nt2.77□□□□□ -1.97
USB1Q12208 CIN8YEL061C 3003 nt2.77□□□□□ -1.97
USB1Q12208 PTM1YKL039W 1572 nt2.77□□□□□ -1.97
USB1Q12208 DOA4YDR069C 2781 nt2.77□□□□□ -1.97
USB1Q12208 SAS4YDR181C 1446 nt2.76□□□□□ -1.97
USB1Q12208 UBP8YMR223W 1416 nt2.76□□□□□ -1.97
USB1Q12208 CHO2YGR157W 2610 nt2.76□□□□□ -1.97
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