Protein–RNA interactions for Protein: Q12129

NMD4, Nonsense-mediated decay protein 4, yeastyeast

Predictions only

Length 218 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
NMD4Q12129 KRE29YER038C 1395 nt3.81□□□□□ -1.8
NMD4Q12129 HSE1YHL002W 1359 nt3.81□□□□□ -1.8
NMD4Q12129 RDS2YPL133C 1341 nt3.81□□□□□ -1.8
NMD4Q12129 HSP30YCR021C 999 nt3.81□□□□□ -1.8
NMD4Q12129 YDR230WYDR230W 348 nt3.81□□□□□ -1.8
NMD4Q12129 YDR340WYDR340W 303 nt3.81□□□□□ -1.8
NMD4Q12129 YGL117WYGL117W 798 nt3.81□□□□□ -1.8
NMD4Q12129 PTI1YGR156W 1278 nt3.81□□□□□ -1.8
NMD4Q12129 TYE7YOR344C 876 nt3.81□□□□□ -1.8
NMD4Q12129 BTS1YPL069C 1008 nt3.81□□□□□ -1.8
NMD4Q12129 DSE1YER124C 1722 nt3.81□□□□□ -1.8
NMD4Q12129 YLR152CYLR152C 1731 nt3.81□□□□□ -1.8
NMD4Q12129 PTA1YAL043C 2358 nt3.81□□□□□ -1.8
NMD4Q12129 EMC1YCL045C 2283 nt3.81□□□□□ -1.8
NMD4Q12129 YBR225WYBR225W 2703 nt3.8□□□□□ -1.8
NMD4Q12129 SPT16YGL207W 3108 nt3.8□□□□□ -1.8
NMD4Q12129 RPL22BYFL034C-A 369 nt3.8□□□□□ -1.8
NMD4Q12129 EPT1YHR123W 1176 nt3.8□□□□□ -1.8
NMD4Q12129 ENT3YJR125C 1227 nt3.8□□□□□ -1.8
NMD4Q12129 YAL066WYAL066W 309 nt3.8□□□□□ -1.8
NMD4Q12129 YOR097CYOR097C 528 nt3.8□□□□□ -1.8
NMD4Q12129 SEC6YIL068C 2418 nt3.8□□□□□ -1.8
NMD4Q12129 ATP5YDR298C 639 nt3.79□□□□□ -1.8
NMD4Q12129 IRC22YEL001C 678 nt3.79□□□□□ -1.8
NMD4Q12129 GPP2YER062C 753 nt3.79□□□□□ -1.8
NMD4Q12129 MPC3YGR243W 441 nt3.79□□□□□ -1.8
NMD4Q12129 AIR1YIL079C 1083 nt3.79□□□□□ -1.8
NMD4Q12129 MOH1YBL049W 417 nt3.79□□□□□ -1.8
NMD4Q12129 YPR136CYPR136C 513 nt3.79□□□□□ -1.8
NMD4Q12129 IMD4YML056C 1575 nt3.79□□□□□ -1.8
NMD4Q12129 SMI1YGR229C 1518 nt3.79□□□□□ -1.8
NMD4Q12129 YDL199CYDL199C 2064 nt3.79□□□□□ -1.8
NMD4Q12129 MTL1YGR023W 1656 nt3.78□□□□□ -1.8
NMD4Q12129 SRO7YPR032W 3102 nt3.78□□□□□ -1.8
NMD4Q12129 CPA2YJR109C 3357 nt3.78□□□□□ -1.8
NMD4Q12129 DBP3YGL078C 1572 nt3.78□□□□□ -1.8
NMD4Q12129 RPS29BYDL061C 171 nt3.78□□□□□ -1.8
NMD4Q12129 RPN9YDR427W 1182 nt3.78□□□□□ -1.8
NMD4Q12129 YGR114CYGR114C 390 nt3.78□□□□□ -1.8
NMD4Q12129 RPL24BYGR148C 468 nt3.78□□□□□ -1.8
NMD4Q12129 RFA3YJL173C 369 nt3.78□□□□□ -1.8
NMD4Q12129 YAL034C-BYAL034C-B 354 nt3.78□□□□□ -1.8
NMD4Q12129 RDN58-1RDN58-1 158 nt3.78□□□□□ -1.8
NMD4Q12129 RDN58-2RDN58-2 158 nt3.78□□□□□ -1.8
NMD4Q12129 YML116W-AYML116W-A 303 nt3.78□□□□□ -1.8
NMD4Q12129 HUB1YNR032C-A 222 nt3.78□□□□□ -1.8
NMD4Q12129 FSH3YOR280C 801 nt3.78□□□□□ -1.8
NMD4Q12129 YPL035CYPL035C 348 nt3.78□□□□□ -1.8
NMD4Q12129 CTP1YBR291C 900 nt3.78□□□□□ -1.8
NMD4Q12129 TFB2YPL122C 1542 nt3.78□□□□□ -1.8
NMD4Q12129 ARP9YMR033W 1404 nt3.78□□□□□ -1.8
NMD4Q12129 SAD1YFR005C 1347 nt3.77□□□□□ -1.81
NMD4Q12129 USA1YML029W 2517 nt3.77□□□□□ -1.81
NMD4Q12129 YPS7YDR349C 1791 nt3.77□□□□□ -1.81
NMD4Q12129 ENT5YDR153C 1236 nt3.77□□□□□ -1.81
NMD4Q12129 RRP17YDR412W 708 nt3.77□□□□□ -1.81
NMD4Q12129 LSM4YER112W 564 nt3.77□□□□□ -1.81
NMD4Q12129 FMP10YER182W 735 nt3.77□□□□□ -1.81
NMD4Q12129 KXD1YGL079W 657 nt3.77□□□□□ -1.81
NMD4Q12129 YGR064WYGR064W 369 nt3.77□□□□□ -1.81
NMD4Q12129 YHR032C-AYHR032C-A 120 nt3.77□□□□□ -1.81
NMD4Q12129 YIR014WYIR014W 729 nt3.77□□□□□ -1.81
NMD4Q12129 YAL004WYAL004W 648 nt3.77□□□□□ -1.81
NMD4Q12129 IRC9YJL142C 393 nt3.77□□□□□ -1.81
NMD4Q12129 SUI2YJR007W 915 nt3.77□□□□□ -1.81
NMD4Q12129 YJR111CYJR111C 852 nt3.77□□□□□ -1.81
NMD4Q12129 SPC2YML055W 537 nt3.77□□□□□ -1.81
NMD4Q12129 SFG1YOR315W 1041 nt3.77□□□□□ -1.81
NMD4Q12129 DIB1YPR082C 432 nt3.77□□□□□ -1.81
NMD4Q12129 GDT1YBR187W 843 nt3.77□□□□□ -1.81
NMD4Q12129 NCR1YPL006W 3513 nt3.77□□□□□ -1.81
NMD4Q12129 MNL1YHR204W 2391 nt3.77□□□□□ -1.81
NMD4Q12129 CDC5YMR001C 2118 nt3.77□□□□□ -1.81
NMD4Q12129 KIN4YOR233W 2403 nt3.76□□□□□ -1.81
NMD4Q12129 SLM2YNL047C 1971 nt3.76□□□□□ -1.81
NMD4Q12129 COM2YER130C 1332 nt3.76□□□□□ -1.81
NMD4Q12129 RPO31YOR116C 4383 nt3.76□□□□□ -1.81
NMD4Q12129 SIN4YNL236W 2925 nt3.76□□□□□ -1.81
NMD4Q12129 PRP31YGR091W 1485 nt3.76□□□□□ -1.81
NMD4Q12129 AHA1YDR214W 1053 nt3.76□□□□□ -1.81
NMD4Q12129 LRS4YDR439W 1044 nt3.76□□□□□ -1.81
NMD4Q12129 APA2YDR530C 978 nt3.76□□□□□ -1.81
NMD4Q12129 YEL010WYEL010W 351 nt3.76□□□□□ -1.81
NMD4Q12129 BUD16YEL029C 939 nt3.76□□□□□ -1.81
NMD4Q12129 COX3Q0275 810 nt3.76□□□□□ -1.81
NMD4Q12129 YIL161WYIL161W 708 nt3.76□□□□□ -1.81
NMD4Q12129 YJL047C-AYJL047C-A 135 nt3.76□□□□□ -1.81
NMD4Q12129 GLG2YJL137C 1143 nt3.76□□□□□ -1.81
NMD4Q12129 YKR070WYKR070W 1059 nt3.76□□□□□ -1.81
NMD4Q12129 SRP40YKR092C 1221 nt3.76□□□□□ -1.81
NMD4Q12129 YLR347W-AYLR347W-A 141 nt3.76□□□□□ -1.81
NMD4Q12129 CSM3YMR048W 954 nt3.76□□□□□ -1.81
NMD4Q12129 MCT1YOR221C 1083 nt3.76□□□□□ -1.81
NMD4Q12129 PHO88YBR106W 567 nt3.76□□□□□ -1.81
NMD4Q12129 STE24YJR117W 1362 nt3.76□□□□□ -1.81
NMD4Q12129 SRP72YPL210C 1923 nt3.76□□□□□ -1.81
NMD4Q12129 YRM1YOR172W 2361 nt3.75□□□□□ -1.81
NMD4Q12129 HUL5YGL141W 2733 nt3.75□□□□□ -1.81
NMD4Q12129 TRK1YJL129C 3708 nt3.75□□□□□ -1.81
NMD4Q12129 YFR057WYFR057W 456 nt3.75□□□□□ -1.81
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