Protein–RNA interactions for Protein: Q12071

VPS54, Vacuolar protein sorting-associated protein 54, yeastyeast

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Length 889 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
VPS54Q12071 YOR365CYOR365C 2112 nt3.67□□□□□ -1.82
VPS54Q12071 YGL074CYGL074C 327 nt3.67□□□□□ -1.82
VPS54Q12071 CAP2YIL034C 864 nt3.67□□□□□ -1.82
VPS54Q12071 SDS3YIL084C 984 nt3.67□□□□□ -1.82
VPS54Q12071 FIP1YJR093C 984 nt3.67□□□□□ -1.82
VPS54Q12071 YAR075WYAR075W 474 nt3.67□□□□□ -1.82
VPS54Q12071 ATG16YMR159C 453 nt3.67□□□□□ -1.82
VPS54Q12071 YPL088WYPL088W 1029 nt3.67□□□□□ -1.82
VPS54Q12071 ATG29YPL166W 642 nt3.67□□□□□ -1.82
VPS54Q12071 YPR078CYPR078C 1119 nt3.67□□□□□ -1.82
VPS54Q12071 SSM4YIL030C 3960 nt3.67□□□□□ -1.82
VPS54Q12071 YPL109CYPL109C 1974 nt3.67□□□□□ -1.82
VPS54Q12071 GCN5YGR252W 1320 nt3.67□□□□□ -1.82
VPS54Q12071 RNR1YER070W 2667 nt3.67□□□□□ -1.82
VPS54Q12071 YLR177WYLR177W 1887 nt3.67□□□□□ -1.82
VPS54Q12071 PRM15YMR278W 1869 nt3.67□□□□□ -1.82
VPS54Q12071 SWI1YPL016W 3945 nt3.66□□□□□ -1.82
VPS54Q12071 GYP6YJL044C 1377 nt3.66□□□□□ -1.82
VPS54Q12071 IZH1YDR492W 951 nt3.66□□□□□ -1.82
VPS54Q12071 FMP32YFL046W 624 nt3.66□□□□□ -1.82
VPS54Q12071 ARI1YGL157W 1044 nt3.66□□□□□ -1.82
VPS54Q12071 YPT35YHR105W 645 nt3.66□□□□□ -1.82
VPS54Q12071 ARC19YKL013C 516 nt3.66□□□□□ -1.82
VPS54Q12071 YMR310CYMR310C 954 nt3.66□□□□□ -1.82
VPS54Q12071 BAG7YOR134W 1230 nt3.66□□□□□ -1.82
VPS54Q12071 SYC1YOR179C 567 nt3.66□□□□□ -1.82
VPS54Q12071 SUR1YPL057C 1149 nt3.66□□□□□ -1.82
VPS54Q12071 SPP381YBR152W 876 nt3.66□□□□□ -1.82
VPS54Q12071 FKH2YNL068C 2589 nt3.66□□□□□ -1.82
VPS54Q12071 KRI1YNL308C 1776 nt3.66□□□□□ -1.82
VPS54Q12071 CET1YPL228W 1650 nt3.65□□□□□ -1.82
VPS54Q12071 PAN5YHR063C 1140 nt3.65□□□□□ -1.83
VPS54Q12071 RFC3YNL290W 1023 nt3.65□□□□□ -1.83
VPS54Q12071 RPC34YNR003C 954 nt3.65□□□□□ -1.83
VPS54Q12071 HNT3YOR258W 654 nt3.65□□□□□ -1.83
VPS54Q12071 RAD2YGR258C 3096 nt3.65□□□□□ -1.83
VPS54Q12071 ATG21YPL100W 1491 nt3.65□□□□□ -1.83
VPS54Q12071 BCS1YDR375C 1371 nt3.64□□□□□ -1.83
VPS54Q12071 GSC2YGR032W 5688 nt3.64□□□□□ -1.83
VPS54Q12071 YPR022CYPR022C 3402 nt3.64□□□□□ -1.83
VPS54Q12071 IRC18YJL037W 675 nt3.64□□□□□ -1.83
VPS54Q12071 RIM11YMR139W 1113 nt3.64□□□□□ -1.83
VPS54Q12071 VAM3YOR106W 852 nt3.64□□□□□ -1.83
VPS54Q12071 TFB6YOR352W 1032 nt3.64□□□□□ -1.83
VPS54Q12071 YOL019WYOL019W 1656 nt3.64□□□□□ -1.83
VPS54Q12071 REB1YBR049C 2433 nt3.64□□□□□ -1.83
VPS54Q12071 RPO21YDL140C 5202 nt3.64□□□□□ -1.83
VPS54Q12071 ISM1YPL040C 3009 nt3.63□□□□□ -1.83
VPS54Q12071 ZDS2YML109W 2829 nt3.63□□□□□ -1.83
VPS54Q12071 GPI1YGR216C 1830 nt3.63□□□□□ -1.83
VPS54Q12071 BUD26YDR241W 288 nt3.63□□□□□ -1.83
VPS54Q12071 SPT4YGR063C 309 nt3.63□□□□□ -1.83
VPS54Q12071 YHL026CYHL026C 948 nt3.63□□□□□ -1.83
VPS54Q12071 YIR014WYIR014W 729 nt3.63□□□□□ -1.83
VPS54Q12071 YKL162CYKL162C 1209 nt3.63□□□□□ -1.83
VPS54Q12071 RPL22AYLR061W 366 nt3.63□□□□□ -1.83
VPS54Q12071 GAB1YLR459W 1185 nt3.63□□□□□ -1.83
VPS54Q12071 YOR082CYOR082C 342 nt3.63□□□□□ -1.83
VPS54Q12071 PLP2YOR281C 861 nt3.63□□□□□ -1.83
VPS54Q12071 RRP7YCL031C 894 nt3.63□□□□□ -1.83
VPS54Q12071 PTM1YKL039W 1572 nt3.63□□□□□ -1.83
VPS54Q12071 ACK1YDL203C 1872 nt3.62□□□□□ -1.83
VPS54Q12071 TLG1YDR468C 675 nt3.62□□□□□ -1.83
VPS54Q12071 BMH1YER177W 804 nt3.62□□□□□ -1.83
VPS54Q12071 ERJ5YFR041C 888 nt3.62□□□□□ -1.83
VPS54Q12071 MTM1YGR257C 1101 nt3.62□□□□□ -1.83
VPS54Q12071 YIL156W-AYIL156W-A 402 nt3.62□□□□□ -1.83
VPS54Q12071 YIR023C-AYIR023C-A 324 nt3.62□□□□□ -1.83
VPS54Q12071 ARG3YJL088W 1017 nt3.62□□□□□ -1.83
VPS54Q12071 ENT3YJR125C 1227 nt3.62□□□□□ -1.83
VPS54Q12071 GTT2YLL060C 702 nt3.62□□□□□ -1.83
VPS54Q12071 DIB1YPR082C 432 nt3.62□□□□□ -1.83
VPS54Q12071 SCD6YPR129W 1050 nt3.62□□□□□ -1.83
VPS54Q12071 YPR136CYPR136C 513 nt3.62□□□□□ -1.83
VPS54Q12071 YBR137WYBR137W 540 nt3.62□□□□□ -1.83
VPS54Q12071 CSH1YBR161W 1131 nt3.62□□□□□ -1.83
VPS54Q12071 UBS1YBR165W 834 nt3.62□□□□□ -1.83
VPS54Q12071 RIB5YBR256C 717 nt3.62□□□□□ -1.83
VPS54Q12071 MSS4YDR208W 2340 nt3.62□□□□□ -1.83
VPS54Q12071 LCB5YLR260W 2064 nt3.62□□□□□ -1.83
VPS54Q12071 DSS1YMR287C 2910 nt3.62□□□□□ -1.83
VPS54Q12071 PWP2YCR057C 2772 nt3.62□□□□□ -1.83
VPS54Q12071 RAD4YER162C 2265 nt3.61□□□□□ -1.83
VPS54Q12071 PMT6YGR199W 2280 nt3.61□□□□□ -1.83
VPS54Q12071 PHO5YBR093C 1404 nt3.61□□□□□ -1.83
VPS54Q12071 SIN4YNL236W 2925 nt3.61□□□□□ -1.83
VPS54Q12071 OSH3YHR073W 2991 nt3.61□□□□□ -1.83
VPS54Q12071 CHK1YBR274W 1584 nt3.61□□□□□ -1.83
VPS54Q12071 PDS1YDR113C 1122 nt3.61□□□□□ -1.83
VPS54Q12071 YDR464C-AYDR464C-A 189 nt3.61□□□□□ -1.83
VPS54Q12071 DCG1YIR030C 735 nt3.61□□□□□ -1.83
VPS54Q12071 YML090WYML090W 387 nt3.61□□□□□ -1.83
VPS54Q12071 MTG1YMR097C 1104 nt3.61□□□□□ -1.83
VPS54Q12071 MRPL27YBR282W 441 nt3.61□□□□□ -1.83
VPS54Q12071 CMK1YFR014C 1341 nt3.61□□□□□ -1.83
VPS54Q12071 CPA2YJR109C 3357 nt3.61□□□□□ -1.83
VPS54Q12071 TMA108YIL137C 2841 nt3.61□□□□□ -1.83
VPS54Q12071 SUC2YIL162W 1599 nt3.6□□□□□ -1.83
VPS54Q12071 YCR016WYCR016W 873 nt3.6□□□□□ -1.83
VPS54Q12071 MRPL11YDL202W 750 nt3.6□□□□□ -1.83
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