Protein–RNA interactions for Protein: Q10570

CPSF1, Cleavage and polyadenylation specificity factor subunit 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,443 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CPSF1Q10570 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC29.38■■■□□ 2.29
CPSF1Q10570 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC29.38■■■□□ 2.29
CPSF1Q10570 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
CPSF1Q10570 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
CPSF1Q10570 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
CPSF1Q10570 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
CPSF1Q10570 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC29.38■■■□□ 2.29
CPSF1Q10570 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
CPSF1Q10570 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
CPSF1Q10570 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC29.37■■■□□ 2.29
CPSF1Q10570 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
CPSF1Q10570 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
CPSF1Q10570 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC29.37■■■□□ 2.29
CPSF1Q10570 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
CPSF1Q10570 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
CPSF1Q10570 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
CPSF1Q10570 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
CPSF1Q10570 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
CPSF1Q10570 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC29.37■■■□□ 2.29
CPSF1Q10570 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
CPSF1Q10570 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
CPSF1Q10570 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC29.37■■■□□ 2.29
CPSF1Q10570 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
CPSF1Q10570 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
CPSF1Q10570 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
CPSF1Q10570 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
CPSF1Q10570 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
CPSF1Q10570 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
CPSF1Q10570 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
CPSF1Q10570 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
CPSF1Q10570 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
CPSF1Q10570 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
CPSF1Q10570 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
CPSF1Q10570 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
CPSF1Q10570 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
CPSF1Q10570 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
CPSF1Q10570 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
CPSF1Q10570 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC29.36■■■□□ 2.29
CPSF1Q10570 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
CPSF1Q10570 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
CPSF1Q10570 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC29.36■■■□□ 2.29
CPSF1Q10570 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
CPSF1Q10570 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
CPSF1Q10570 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
CPSF1Q10570 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
CPSF1Q10570 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
CPSF1Q10570 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
CPSF1Q10570 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
CPSF1Q10570 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC29.35■■■□□ 2.29
CPSF1Q10570 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
CPSF1Q10570 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC29.35■■■□□ 2.29
CPSF1Q10570 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
CPSF1Q10570 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
CPSF1Q10570 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
CPSF1Q10570 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
CPSF1Q10570 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
CPSF1Q10570 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC29.34■■■□□ 2.29
CPSF1Q10570 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC29.34■■■□□ 2.29
CPSF1Q10570 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
CPSF1Q10570 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
CPSF1Q10570 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
CPSF1Q10570 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
CPSF1Q10570 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
CPSF1Q10570 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC29.33■■■□□ 2.29
CPSF1Q10570 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
CPSF1Q10570 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC29.33■■■□□ 2.29
CPSF1Q10570 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC29.33■■■□□ 2.29
CPSF1Q10570 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
CPSF1Q10570 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
CPSF1Q10570 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC29.33■■■□□ 2.29
CPSF1Q10570 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.33■■■□□ 2.29
CPSF1Q10570 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
CPSF1Q10570 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
CPSF1Q10570 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC29.32■■■□□ 2.28
CPSF1Q10570 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC29.32■■■□□ 2.28
CPSF1Q10570 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
CPSF1Q10570 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
CPSF1Q10570 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
CPSF1Q10570 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC29.32■■■□□ 2.28
CPSF1Q10570 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC29.32■■■□□ 2.28
CPSF1Q10570 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
CPSF1Q10570 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
CPSF1Q10570 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
CPSF1Q10570 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
CPSF1Q10570 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
CPSF1Q10570 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
CPSF1Q10570 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
CPSF1Q10570 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
CPSF1Q10570 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
CPSF1Q10570 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
CPSF1Q10570 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
CPSF1Q10570 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
CPSF1Q10570 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
CPSF1Q10570 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
CPSF1Q10570 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
CPSF1Q10570 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
CPSF1Q10570 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
CPSF1Q10570 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
CPSF1Q10570 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
CPSF1Q10570 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC29.29■■■□□ 2.28
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