Protein–RNA interactions for Protein: Q07699

SCN1B, Sodium channel subunit beta-1, humanhuman

Predictions only

Length 218 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN1BQ07699 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
SCN1BQ07699 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
SCN1BQ07699 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
SCN1BQ07699 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
SCN1BQ07699 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SCN1BQ07699 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SCN1BQ07699 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SCN1BQ07699 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SCN1BQ07699 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SCN1BQ07699 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SCN1BQ07699 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SCN1BQ07699 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SCN1BQ07699 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SCN1BQ07699 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SCN1BQ07699 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SCN1BQ07699 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SCN1BQ07699 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SCN1BQ07699 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SCN1BQ07699 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SCN1BQ07699 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SCN1BQ07699 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SCN1BQ07699 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SCN1BQ07699 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SCN1BQ07699 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SCN1BQ07699 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SCN1BQ07699 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SCN1BQ07699 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
SCN1BQ07699 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SCN1BQ07699 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
SCN1BQ07699 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SCN1BQ07699 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
SCN1BQ07699 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SCN1BQ07699 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SCN1BQ07699 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SCN1BQ07699 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SCN1BQ07699 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SCN1BQ07699 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
SCN1BQ07699 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
SCN1BQ07699 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
SCN1BQ07699 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SCN1BQ07699 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SCN1BQ07699 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC18.99■□□□□ 0.63
SCN1BQ07699 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC18.99■□□□□ 0.63
SCN1BQ07699 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC18.99■□□□□ 0.63
SCN1BQ07699 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
SCN1BQ07699 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SCN1BQ07699 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SCN1BQ07699 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SCN1BQ07699 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
SCN1BQ07699 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SCN1BQ07699 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SCN1BQ07699 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SCN1BQ07699 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SCN1BQ07699 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SCN1BQ07699 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SCN1BQ07699 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SCN1BQ07699 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
SCN1BQ07699 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SCN1BQ07699 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SCN1BQ07699 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
SCN1BQ07699 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
SCN1BQ07699 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SCN1BQ07699 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SCN1BQ07699 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SCN1BQ07699 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SCN1BQ07699 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SCN1BQ07699 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SCN1BQ07699 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
SCN1BQ07699 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SCN1BQ07699 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SCN1BQ07699 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
SCN1BQ07699 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SCN1BQ07699 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SCN1BQ07699 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SCN1BQ07699 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
SCN1BQ07699 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
SCN1BQ07699 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SCN1BQ07699 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SCN1BQ07699 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
SCN1BQ07699 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
SCN1BQ07699 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC18.97■□□□□ 0.63
SCN1BQ07699 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SCN1BQ07699 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SCN1BQ07699 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SCN1BQ07699 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
SCN1BQ07699 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
SCN1BQ07699 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SCN1BQ07699 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
SCN1BQ07699 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SCN1BQ07699 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SCN1BQ07699 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
SCN1BQ07699 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
SCN1BQ07699 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SCN1BQ07699 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
SCN1BQ07699 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
SCN1BQ07699 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
SCN1BQ07699 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SCN1BQ07699 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
SCN1BQ07699 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SCN1BQ07699 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.9 ms