Protein–RNA interactions for Protein: Q07343

PDE4B, cAMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase 4B, humanhuman

Predictions only

Length 736 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4BQ07343 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
PDE4BQ07343 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PDE4BQ07343 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PDE4BQ07343 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PDE4BQ07343 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PDE4BQ07343 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC25.42■■□□□ 1.66
PDE4BQ07343 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC25.42■■□□□ 1.66
PDE4BQ07343 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
PDE4BQ07343 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
PDE4BQ07343 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC25.42■■□□□ 1.66
PDE4BQ07343 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PDE4BQ07343 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC25.42■■□□□ 1.66
PDE4BQ07343 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
PDE4BQ07343 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
PDE4BQ07343 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
PDE4BQ07343 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC25.42■■□□□ 1.66
PDE4BQ07343 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
PDE4BQ07343 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PDE4BQ07343 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PDE4BQ07343 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PDE4BQ07343 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
PDE4BQ07343 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PDE4BQ07343 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PDE4BQ07343 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PDE4BQ07343 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PDE4BQ07343 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PDE4BQ07343 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PDE4BQ07343 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PDE4BQ07343 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
PDE4BQ07343 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
PDE4BQ07343 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PDE4BQ07343 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PDE4BQ07343 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PDE4BQ07343 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
PDE4BQ07343 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PDE4BQ07343 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
PDE4BQ07343 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC25.4■■□□□ 1.66
PDE4BQ07343 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PDE4BQ07343 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
PDE4BQ07343 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
PDE4BQ07343 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
PDE4BQ07343 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PDE4BQ07343 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
PDE4BQ07343 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PDE4BQ07343 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
PDE4BQ07343 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
PDE4BQ07343 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
PDE4BQ07343 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
PDE4BQ07343 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
PDE4BQ07343 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
PDE4BQ07343 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
PDE4BQ07343 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
PDE4BQ07343 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC25.39■■□□□ 1.66
PDE4BQ07343 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
PDE4BQ07343 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
PDE4BQ07343 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC25.39■■□□□ 1.66
PDE4BQ07343 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC25.39■■□□□ 1.66
PDE4BQ07343 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
PDE4BQ07343 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
PDE4BQ07343 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PDE4BQ07343 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
PDE4BQ07343 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PDE4BQ07343 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
PDE4BQ07343 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PDE4BQ07343 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
PDE4BQ07343 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
PDE4BQ07343 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
PDE4BQ07343 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
PDE4BQ07343 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
PDE4BQ07343 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PDE4BQ07343 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
PDE4BQ07343 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PDE4BQ07343 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
PDE4BQ07343 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PDE4BQ07343 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PDE4BQ07343 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PDE4BQ07343 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PDE4BQ07343 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PDE4BQ07343 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PDE4BQ07343 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PDE4BQ07343 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PDE4BQ07343 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PDE4BQ07343 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PDE4BQ07343 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PDE4BQ07343 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PDE4BQ07343 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PDE4BQ07343 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PDE4BQ07343 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
PDE4BQ07343 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PDE4BQ07343 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PDE4BQ07343 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
PDE4BQ07343 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
PDE4BQ07343 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PDE4BQ07343 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
PDE4BQ07343 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PDE4BQ07343 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PDE4BQ07343 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
PDE4BQ07343 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PDE4BQ07343 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
PDE4BQ07343 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31 ms