Protein–RNA interactions for Protein: Q07002

CDK18, Cyclin-dependent kinase 18, humanhuman

Predictions only

Length 472 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK18Q07002 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CDK18Q07002 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CDK18Q07002 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CDK18Q07002 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CDK18Q07002 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CDK18Q07002 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CDK18Q07002 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CDK18Q07002 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CDK18Q07002 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CDK18Q07002 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CDK18Q07002 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CDK18Q07002 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CDK18Q07002 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CDK18Q07002 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CDK18Q07002 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CDK18Q07002 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CDK18Q07002 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CDK18Q07002 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CDK18Q07002 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CDK18Q07002 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CDK18Q07002 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CDK18Q07002 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CDK18Q07002 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CDK18Q07002 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CDK18Q07002 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CDK18Q07002 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CDK18Q07002 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CDK18Q07002 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CDK18Q07002 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CDK18Q07002 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CDK18Q07002 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CDK18Q07002 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CDK18Q07002 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CDK18Q07002 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CDK18Q07002 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CDK18Q07002 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CDK18Q07002 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
CDK18Q07002 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
CDK18Q07002 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC21.83■■□□□ 1.08
CDK18Q07002 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
CDK18Q07002 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CDK18Q07002 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CDK18Q07002 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CDK18Q07002 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CDK18Q07002 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CDK18Q07002 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CDK18Q07002 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CDK18Q07002 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CDK18Q07002 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CDK18Q07002 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CDK18Q07002 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CDK18Q07002 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CDK18Q07002 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CDK18Q07002 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CDK18Q07002 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CDK18Q07002 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CDK18Q07002 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CDK18Q07002 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CDK18Q07002 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CDK18Q07002 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CDK18Q07002 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CDK18Q07002 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CDK18Q07002 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CDK18Q07002 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CDK18Q07002 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CDK18Q07002 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CDK18Q07002 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CDK18Q07002 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CDK18Q07002 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CDK18Q07002 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CDK18Q07002 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CDK18Q07002 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CDK18Q07002 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CDK18Q07002 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CDK18Q07002 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CDK18Q07002 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CDK18Q07002 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CDK18Q07002 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CDK18Q07002 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CDK18Q07002 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CDK18Q07002 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CDK18Q07002 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CDK18Q07002 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CDK18Q07002 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CDK18Q07002 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CDK18Q07002 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CDK18Q07002 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CDK18Q07002 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CDK18Q07002 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CDK18Q07002 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CDK18Q07002 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CDK18Q07002 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CDK18Q07002 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CDK18Q07002 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CDK18Q07002 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CDK18Q07002 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CDK18Q07002 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CDK18Q07002 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
CDK18Q07002 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CDK18Q07002 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.4 ms