Protein–RNA interactions for Protein: Q06889

EGR3, Early growth response protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 387 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EGR3Q06889 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
EGR3Q06889 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
EGR3Q06889 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
EGR3Q06889 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
EGR3Q06889 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
EGR3Q06889 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
EGR3Q06889 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.62
EGR3Q06889 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
EGR3Q06889 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
EGR3Q06889 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
EGR3Q06889 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.62
EGR3Q06889 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
EGR3Q06889 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
EGR3Q06889 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
EGR3Q06889 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
EGR3Q06889 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
EGR3Q06889 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
EGR3Q06889 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
EGR3Q06889 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
EGR3Q06889 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
EGR3Q06889 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
EGR3Q06889 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
EGR3Q06889 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
EGR3Q06889 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
EGR3Q06889 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
EGR3Q06889 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
EGR3Q06889 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
EGR3Q06889 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
EGR3Q06889 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
EGR3Q06889 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
EGR3Q06889 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
EGR3Q06889 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
EGR3Q06889 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
EGR3Q06889 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
EGR3Q06889 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
EGR3Q06889 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
EGR3Q06889 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
EGR3Q06889 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
EGR3Q06889 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
EGR3Q06889 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
EGR3Q06889 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
EGR3Q06889 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
EGR3Q06889 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
EGR3Q06889 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
EGR3Q06889 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
EGR3Q06889 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
EGR3Q06889 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
EGR3Q06889 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
EGR3Q06889 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
EGR3Q06889 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
EGR3Q06889 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
EGR3Q06889 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
EGR3Q06889 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
EGR3Q06889 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
EGR3Q06889 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
EGR3Q06889 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
EGR3Q06889 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
EGR3Q06889 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
EGR3Q06889 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
EGR3Q06889 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
EGR3Q06889 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
EGR3Q06889 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC18.87■□□□□ 0.61
EGR3Q06889 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
EGR3Q06889 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
EGR3Q06889 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC18.86■□□□□ 0.61
EGR3Q06889 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
EGR3Q06889 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
EGR3Q06889 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
EGR3Q06889 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
EGR3Q06889 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
EGR3Q06889 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
EGR3Q06889 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
EGR3Q06889 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
EGR3Q06889 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
EGR3Q06889 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
EGR3Q06889 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
EGR3Q06889 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC18.85■□□□□ 0.61
EGR3Q06889 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
EGR3Q06889 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
EGR3Q06889 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
EGR3Q06889 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
EGR3Q06889 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
EGR3Q06889 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
EGR3Q06889 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
EGR3Q06889 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
EGR3Q06889 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
EGR3Q06889 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
EGR3Q06889 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
EGR3Q06889 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
EGR3Q06889 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
EGR3Q06889 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
EGR3Q06889 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
EGR3Q06889 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
EGR3Q06889 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
EGR3Q06889 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
EGR3Q06889 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
EGR3Q06889 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
EGR3Q06889 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
EGR3Q06889 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
EGR3Q06889 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.7 ms