Protein–RNA interactions for Protein: Q06136

KDSR, 3-ketodihydrosphingosine reductase, humanhuman

Predictions only

Length 332 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDSRQ06136 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
KDSRQ06136 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
KDSRQ06136 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
KDSRQ06136 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
KDSRQ06136 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
KDSRQ06136 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
KDSRQ06136 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
KDSRQ06136 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
KDSRQ06136 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
KDSRQ06136 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
KDSRQ06136 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
KDSRQ06136 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
KDSRQ06136 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
KDSRQ06136 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC22.34■■□□□ 1.17
KDSRQ06136 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
KDSRQ06136 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
KDSRQ06136 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
KDSRQ06136 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
KDSRQ06136 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
KDSRQ06136 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
KDSRQ06136 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
KDSRQ06136 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
KDSRQ06136 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
KDSRQ06136 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
KDSRQ06136 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
KDSRQ06136 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
KDSRQ06136 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
KDSRQ06136 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
KDSRQ06136 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
KDSRQ06136 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
KDSRQ06136 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
KDSRQ06136 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
KDSRQ06136 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
KDSRQ06136 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
KDSRQ06136 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
KDSRQ06136 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
KDSRQ06136 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
KDSRQ06136 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
KDSRQ06136 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
KDSRQ06136 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
KDSRQ06136 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
KDSRQ06136 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
KDSRQ06136 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
KDSRQ06136 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
KDSRQ06136 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
KDSRQ06136 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
KDSRQ06136 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
KDSRQ06136 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
KDSRQ06136 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
KDSRQ06136 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
KDSRQ06136 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
KDSRQ06136 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
KDSRQ06136 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
KDSRQ06136 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
KDSRQ06136 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
KDSRQ06136 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
KDSRQ06136 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
KDSRQ06136 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
KDSRQ06136 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
KDSRQ06136 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
KDSRQ06136 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
KDSRQ06136 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
KDSRQ06136 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
KDSRQ06136 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
KDSRQ06136 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
KDSRQ06136 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
KDSRQ06136 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
KDSRQ06136 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
KDSRQ06136 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
KDSRQ06136 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
KDSRQ06136 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC22.3■■□□□ 1.16
KDSRQ06136 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
KDSRQ06136 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
KDSRQ06136 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC22.3■■□□□ 1.16
KDSRQ06136 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
KDSRQ06136 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
KDSRQ06136 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
KDSRQ06136 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
KDSRQ06136 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
KDSRQ06136 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC22.29■■□□□ 1.16
KDSRQ06136 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
KDSRQ06136 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
KDSRQ06136 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
KDSRQ06136 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
KDSRQ06136 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
KDSRQ06136 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
KDSRQ06136 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
KDSRQ06136 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
KDSRQ06136 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
KDSRQ06136 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
KDSRQ06136 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
KDSRQ06136 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
KDSRQ06136 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
KDSRQ06136 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
KDSRQ06136 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
KDSRQ06136 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
KDSRQ06136 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
KDSRQ06136 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
KDSRQ06136 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
KDSRQ06136 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.9 ms