Protein–RNA interactions for Protein: Q05682

CALD1, Caldesmon, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 793 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CALD1Q05682 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
CALD1Q05682 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC27.98■■■□□ 2.07
CALD1Q05682 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC27.98■■■□□ 2.07
CALD1Q05682 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
CALD1Q05682 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
CALD1Q05682 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
CALD1Q05682 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
CALD1Q05682 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
CALD1Q05682 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
CALD1Q05682 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
CALD1Q05682 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
CALD1Q05682 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
CALD1Q05682 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC27.97■■■□□ 2.07
CALD1Q05682 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
CALD1Q05682 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
CALD1Q05682 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
CALD1Q05682 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
CALD1Q05682 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
CALD1Q05682 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
CALD1Q05682 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
CALD1Q05682 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
CALD1Q05682 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
CALD1Q05682 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
CALD1Q05682 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
CALD1Q05682 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
CALD1Q05682 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
CALD1Q05682 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.96■■■□□ 2.07
CALD1Q05682 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC27.96■■■□□ 2.07
CALD1Q05682 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
CALD1Q05682 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
CALD1Q05682 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
CALD1Q05682 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
CALD1Q05682 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
CALD1Q05682 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
CALD1Q05682 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
CALD1Q05682 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.07
CALD1Q05682 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.07
CALD1Q05682 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
CALD1Q05682 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
CALD1Q05682 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
CALD1Q05682 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
CALD1Q05682 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
CALD1Q05682 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
CALD1Q05682 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
CALD1Q05682 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
CALD1Q05682 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
CALD1Q05682 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.94■■■□□ 2.06
CALD1Q05682 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
CALD1Q05682 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
CALD1Q05682 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
CALD1Q05682 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC27.94■■■□□ 2.06
CALD1Q05682 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
CALD1Q05682 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
CALD1Q05682 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC27.94■■■□□ 2.06
CALD1Q05682 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
CALD1Q05682 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
CALD1Q05682 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
CALD1Q05682 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
CALD1Q05682 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
CALD1Q05682 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
CALD1Q05682 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
CALD1Q05682 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
CALD1Q05682 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
CALD1Q05682 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
CALD1Q05682 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
CALD1Q05682 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
CALD1Q05682 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
CALD1Q05682 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
CALD1Q05682 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
CALD1Q05682 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC27.92■■■□□ 2.06
CALD1Q05682 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
CALD1Q05682 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC27.92■■■□□ 2.06
CALD1Q05682 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
CALD1Q05682 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
CALD1Q05682 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
CALD1Q05682 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
CALD1Q05682 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
CALD1Q05682 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
CALD1Q05682 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
CALD1Q05682 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
CALD1Q05682 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
CALD1Q05682 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
CALD1Q05682 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC27.91■■■□□ 2.06
CALD1Q05682 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
CALD1Q05682 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
CALD1Q05682 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
CALD1Q05682 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
CALD1Q05682 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
CALD1Q05682 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
CALD1Q05682 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC27.9■■■□□ 2.06
CALD1Q05682 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
CALD1Q05682 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
CALD1Q05682 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
CALD1Q05682 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
CALD1Q05682 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
CALD1Q05682 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
CALD1Q05682 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
CALD1Q05682 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC27.9■■■□□ 2.06
CALD1Q05682 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC27.9■■■□□ 2.06
CALD1Q05682 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.4 ms