Protein–RNA interactions for Protein: Q04844

CHRNE, Acetylcholine receptor subunit epsilon, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNEQ04844 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CHRNEQ04844 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CHRNEQ04844 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CHRNEQ04844 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CHRNEQ04844 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CHRNEQ04844 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CHRNEQ04844 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CHRNEQ04844 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CHRNEQ04844 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CHRNEQ04844 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CHRNEQ04844 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CHRNEQ04844 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CHRNEQ04844 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CHRNEQ04844 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CHRNEQ04844 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CHRNEQ04844 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CHRNEQ04844 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CHRNEQ04844 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CHRNEQ04844 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CHRNEQ04844 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CHRNEQ04844 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CHRNEQ04844 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CHRNEQ04844 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CHRNEQ04844 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CHRNEQ04844 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CHRNEQ04844 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CHRNEQ04844 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CHRNEQ04844 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CHRNEQ04844 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CHRNEQ04844 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CHRNEQ04844 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CHRNEQ04844 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CHRNEQ04844 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
CHRNEQ04844 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CHRNEQ04844 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CHRNEQ04844 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CHRNEQ04844 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CHRNEQ04844 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CHRNEQ04844 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CHRNEQ04844 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
CHRNEQ04844 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CHRNEQ04844 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CHRNEQ04844 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CHRNEQ04844 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CHRNEQ04844 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CHRNEQ04844 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CHRNEQ04844 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CHRNEQ04844 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
CHRNEQ04844 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CHRNEQ04844 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CHRNEQ04844 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CHRNEQ04844 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CHRNEQ04844 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CHRNEQ04844 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CHRNEQ04844 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CHRNEQ04844 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
CHRNEQ04844 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.79
CHRNEQ04844 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CHRNEQ04844 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CHRNEQ04844 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CHRNEQ04844 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
CHRNEQ04844 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CHRNEQ04844 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CHRNEQ04844 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CHRNEQ04844 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CHRNEQ04844 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
CHRNEQ04844 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CHRNEQ04844 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CHRNEQ04844 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CHRNEQ04844 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CHRNEQ04844 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CHRNEQ04844 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CHRNEQ04844 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CHRNEQ04844 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CHRNEQ04844 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CHRNEQ04844 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CHRNEQ04844 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CHRNEQ04844 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CHRNEQ04844 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CHRNEQ04844 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CHRNEQ04844 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CHRNEQ04844 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CHRNEQ04844 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CHRNEQ04844 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
CHRNEQ04844 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CHRNEQ04844 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CHRNEQ04844 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CHRNEQ04844 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CHRNEQ04844 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CHRNEQ04844 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CHRNEQ04844 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CHRNEQ04844 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CHRNEQ04844 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CHRNEQ04844 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CHRNEQ04844 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CHRNEQ04844 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CHRNEQ04844 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CHRNEQ04844 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CHRNEQ04844 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CHRNEQ04844 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.1 ms