Protein–RNA interactions for Protein: Q03721

KCNC4, Potassium voltage-gated channel subfamily C member 4, humanhuman

Predictions only

Length 635 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNC4Q03721 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
KCNC4Q03721 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
KCNC4Q03721 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
KCNC4Q03721 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
KCNC4Q03721 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
KCNC4Q03721 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
KCNC4Q03721 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
KCNC4Q03721 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
KCNC4Q03721 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
KCNC4Q03721 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
KCNC4Q03721 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
KCNC4Q03721 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
KCNC4Q03721 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
KCNC4Q03721 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
KCNC4Q03721 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
KCNC4Q03721 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
KCNC4Q03721 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
KCNC4Q03721 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
KCNC4Q03721 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
KCNC4Q03721 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
KCNC4Q03721 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC20.61■□□□□ 0.89
KCNC4Q03721 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
KCNC4Q03721 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
KCNC4Q03721 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
KCNC4Q03721 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
KCNC4Q03721 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
KCNC4Q03721 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
KCNC4Q03721 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
KCNC4Q03721 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
KCNC4Q03721 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
KCNC4Q03721 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
KCNC4Q03721 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
KCNC4Q03721 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
KCNC4Q03721 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
KCNC4Q03721 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
KCNC4Q03721 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
KCNC4Q03721 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
KCNC4Q03721 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
KCNC4Q03721 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
KCNC4Q03721 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
KCNC4Q03721 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
KCNC4Q03721 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
KCNC4Q03721 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
KCNC4Q03721 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
KCNC4Q03721 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
KCNC4Q03721 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
KCNC4Q03721 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
KCNC4Q03721 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
KCNC4Q03721 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
KCNC4Q03721 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
KCNC4Q03721 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
KCNC4Q03721 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
KCNC4Q03721 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
KCNC4Q03721 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
KCNC4Q03721 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
KCNC4Q03721 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
KCNC4Q03721 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
KCNC4Q03721 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
KCNC4Q03721 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
KCNC4Q03721 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
KCNC4Q03721 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
KCNC4Q03721 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
KCNC4Q03721 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
KCNC4Q03721 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
KCNC4Q03721 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
KCNC4Q03721 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
KCNC4Q03721 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
KCNC4Q03721 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
KCNC4Q03721 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
KCNC4Q03721 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
KCNC4Q03721 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
KCNC4Q03721 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
KCNC4Q03721 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
KCNC4Q03721 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
KCNC4Q03721 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
KCNC4Q03721 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
KCNC4Q03721 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
KCNC4Q03721 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
KCNC4Q03721 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
KCNC4Q03721 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
KCNC4Q03721 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
KCNC4Q03721 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
KCNC4Q03721 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
KCNC4Q03721 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
KCNC4Q03721 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
KCNC4Q03721 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
KCNC4Q03721 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
KCNC4Q03721 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
KCNC4Q03721 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
KCNC4Q03721 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
KCNC4Q03721 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
KCNC4Q03721 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
KCNC4Q03721 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
KCNC4Q03721 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
KCNC4Q03721 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
KCNC4Q03721 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
KCNC4Q03721 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
KCNC4Q03721 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
KCNC4Q03721 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
KCNC4Q03721 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.4 ms