Protein–RNA interactions for Protein: Q03518

TAP1, Antigen peptide transporter 1, humanhuman

Predictions only

Length 808 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAP1Q03518 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TAP1Q03518 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TAP1Q03518 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TAP1Q03518 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TAP1Q03518 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TAP1Q03518 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TAP1Q03518 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TAP1Q03518 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
TAP1Q03518 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
TAP1Q03518 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
TAP1Q03518 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TAP1Q03518 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
TAP1Q03518 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
TAP1Q03518 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TAP1Q03518 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TAP1Q03518 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TAP1Q03518 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TAP1Q03518 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TAP1Q03518 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
TAP1Q03518 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
TAP1Q03518 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
TAP1Q03518 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
TAP1Q03518 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
TAP1Q03518 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
TAP1Q03518 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
TAP1Q03518 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
TAP1Q03518 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
TAP1Q03518 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
TAP1Q03518 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
TAP1Q03518 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
TAP1Q03518 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
TAP1Q03518 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
TAP1Q03518 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
TAP1Q03518 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TAP1Q03518 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TAP1Q03518 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TAP1Q03518 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TAP1Q03518 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TAP1Q03518 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TAP1Q03518 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TAP1Q03518 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TAP1Q03518 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TAP1Q03518 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TAP1Q03518 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TAP1Q03518 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TAP1Q03518 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TAP1Q03518 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TAP1Q03518 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TAP1Q03518 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TAP1Q03518 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TAP1Q03518 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TAP1Q03518 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
TAP1Q03518 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
TAP1Q03518 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TAP1Q03518 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TAP1Q03518 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TAP1Q03518 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TAP1Q03518 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TAP1Q03518 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TAP1Q03518 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TAP1Q03518 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TAP1Q03518 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TAP1Q03518 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TAP1Q03518 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
TAP1Q03518 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
TAP1Q03518 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
TAP1Q03518 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
TAP1Q03518 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
TAP1Q03518 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC23.55■■□□□ 1.36
TAP1Q03518 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
TAP1Q03518 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
TAP1Q03518 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
TAP1Q03518 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
TAP1Q03518 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
TAP1Q03518 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
TAP1Q03518 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TAP1Q03518 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TAP1Q03518 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TAP1Q03518 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
TAP1Q03518 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TAP1Q03518 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TAP1Q03518 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TAP1Q03518 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TAP1Q03518 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
TAP1Q03518 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TAP1Q03518 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
TAP1Q03518 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TAP1Q03518 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TAP1Q03518 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TAP1Q03518 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
TAP1Q03518 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
TAP1Q03518 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC23.53■■□□□ 1.36
TAP1Q03518 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
TAP1Q03518 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
TAP1Q03518 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TAP1Q03518 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TAP1Q03518 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TAP1Q03518 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TAP1Q03518 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TAP1Q03518 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.4 ms