Protein–RNA interactions for Protein: Q02641

CACNB1, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit beta-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 598 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNB1Q02641 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CACNB1Q02641 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CACNB1Q02641 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CACNB1Q02641 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CACNB1Q02641 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CACNB1Q02641 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CACNB1Q02641 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CACNB1Q02641 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CACNB1Q02641 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
CACNB1Q02641 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
CACNB1Q02641 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
CACNB1Q02641 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CACNB1Q02641 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CACNB1Q02641 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CACNB1Q02641 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CACNB1Q02641 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CACNB1Q02641 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CACNB1Q02641 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CACNB1Q02641 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CACNB1Q02641 AL606534.3-201ENST00000437499 373 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CACNB1Q02641 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CACNB1Q02641 AC092067.1-201ENST00000592929 488 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CACNB1Q02641 AC093648.1-201ENST00000623546 606 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
CACNB1Q02641 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CACNB1Q02641 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CACNB1Q02641 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CACNB1Q02641 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CACNB1Q02641 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CACNB1Q02641 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CACNB1Q02641 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CACNB1Q02641 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CACNB1Q02641 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CACNB1Q02641 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CACNB1Q02641 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CACNB1Q02641 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CACNB1Q02641 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CACNB1Q02641 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CACNB1Q02641 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CACNB1Q02641 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CACNB1Q02641 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CACNB1Q02641 LINC01014-203ENST00000455307 548 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CACNB1Q02641 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CACNB1Q02641 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CACNB1Q02641 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CACNB1Q02641 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CACNB1Q02641 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CACNB1Q02641 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CACNB1Q02641 AC010326.4-201ENST00000604665 891 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
CACNB1Q02641 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CACNB1Q02641 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CACNB1Q02641 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CACNB1Q02641 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CACNB1Q02641 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CACNB1Q02641 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CACNB1Q02641 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CACNB1Q02641 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CACNB1Q02641 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CACNB1Q02641 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CACNB1Q02641 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CACNB1Q02641 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CACNB1Q02641 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CACNB1Q02641 ATP5L2-201ENST00000505920 799 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CACNB1Q02641 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CACNB1Q02641 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CACNB1Q02641 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CACNB1Q02641 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CACNB1Q02641 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CACNB1Q02641 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CACNB1Q02641 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CACNB1Q02641 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CACNB1Q02641 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CACNB1Q02641 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CACNB1Q02641 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CACNB1Q02641 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CACNB1Q02641 AL136370.1-201ENST00000608166 691 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
CACNB1Q02641 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CACNB1Q02641 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CACNB1Q02641 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CACNB1Q02641 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CACNB1Q02641 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CACNB1Q02641 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CACNB1Q02641 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CACNB1Q02641 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CACNB1Q02641 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CACNB1Q02641 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CACNB1Q02641 AL158013.1-202ENST00000419666 520 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CACNB1Q02641 MTND1P31-201ENST00000449206 961 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
CACNB1Q02641 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CACNB1Q02641 OR13I1P-201ENST00000609811 1264 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
CACNB1Q02641 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CACNB1Q02641 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
CACNB1Q02641 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
CACNB1Q02641 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CACNB1Q02641 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CACNB1Q02641 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CACNB1Q02641 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CACNB1Q02641 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
CACNB1Q02641 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CACNB1Q02641 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CACNB1Q02641 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.2 ms