Protein–RNA interactions for Protein: Q02556

IRF8, Interferon regulatory factor 8, humanhuman

Predictions only

Length 426 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRF8Q02556 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC20.8■□□□□ 0.92
IRF8Q02556 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
IRF8Q02556 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
IRF8Q02556 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
IRF8Q02556 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
IRF8Q02556 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
IRF8Q02556 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
IRF8Q02556 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
IRF8Q02556 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
IRF8Q02556 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
IRF8Q02556 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
IRF8Q02556 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
IRF8Q02556 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
IRF8Q02556 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
IRF8Q02556 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
IRF8Q02556 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
IRF8Q02556 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
IRF8Q02556 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
IRF8Q02556 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
IRF8Q02556 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
IRF8Q02556 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
IRF8Q02556 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
IRF8Q02556 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
IRF8Q02556 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
IRF8Q02556 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC20.78■□□□□ 0.92
IRF8Q02556 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
IRF8Q02556 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
IRF8Q02556 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
IRF8Q02556 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
IRF8Q02556 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
IRF8Q02556 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
IRF8Q02556 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
IRF8Q02556 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
IRF8Q02556 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
IRF8Q02556 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
IRF8Q02556 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
IRF8Q02556 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
IRF8Q02556 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
IRF8Q02556 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
IRF8Q02556 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
IRF8Q02556 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC20.77■□□□□ 0.92
IRF8Q02556 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
IRF8Q02556 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
IRF8Q02556 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
IRF8Q02556 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
IRF8Q02556 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
IRF8Q02556 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
IRF8Q02556 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
IRF8Q02556 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC20.77■□□□□ 0.92
IRF8Q02556 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
IRF8Q02556 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
IRF8Q02556 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
IRF8Q02556 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.91
IRF8Q02556 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
IRF8Q02556 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
IRF8Q02556 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
IRF8Q02556 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
IRF8Q02556 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
IRF8Q02556 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
IRF8Q02556 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
IRF8Q02556 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
IRF8Q02556 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
IRF8Q02556 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
IRF8Q02556 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
IRF8Q02556 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
IRF8Q02556 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
IRF8Q02556 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
IRF8Q02556 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
IRF8Q02556 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
IRF8Q02556 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.75■□□□□ 0.91
IRF8Q02556 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
IRF8Q02556 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
IRF8Q02556 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
IRF8Q02556 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
IRF8Q02556 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
IRF8Q02556 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
IRF8Q02556 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
IRF8Q02556 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
IRF8Q02556 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
IRF8Q02556 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
IRF8Q02556 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
IRF8Q02556 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
IRF8Q02556 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
IRF8Q02556 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
IRF8Q02556 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
IRF8Q02556 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
IRF8Q02556 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
IRF8Q02556 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
IRF8Q02556 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
IRF8Q02556 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
IRF8Q02556 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
IRF8Q02556 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
IRF8Q02556 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
IRF8Q02556 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
IRF8Q02556 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
IRF8Q02556 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
IRF8Q02556 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
IRF8Q02556 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
IRF8Q02556 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
IRF8Q02556 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.4 ms