Protein–RNA interactions for Protein: Q02413

DSG1, Desmoglein-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,049 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DSG1Q02413 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
DSG1Q02413 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
DSG1Q02413 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
DSG1Q02413 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
DSG1Q02413 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
DSG1Q02413 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
DSG1Q02413 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
DSG1Q02413 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
DSG1Q02413 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
DSG1Q02413 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
DSG1Q02413 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
DSG1Q02413 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
DSG1Q02413 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
DSG1Q02413 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
DSG1Q02413 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
DSG1Q02413 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
DSG1Q02413 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
DSG1Q02413 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
DSG1Q02413 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC22.97■■□□□ 1.27
DSG1Q02413 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
DSG1Q02413 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
DSG1Q02413 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
DSG1Q02413 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
DSG1Q02413 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
DSG1Q02413 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
DSG1Q02413 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
DSG1Q02413 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
DSG1Q02413 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
DSG1Q02413 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
DSG1Q02413 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
DSG1Q02413 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
DSG1Q02413 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
DSG1Q02413 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
DSG1Q02413 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
DSG1Q02413 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
DSG1Q02413 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
DSG1Q02413 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
DSG1Q02413 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC22.96■■□□□ 1.27
DSG1Q02413 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
DSG1Q02413 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
DSG1Q02413 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
DSG1Q02413 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
DSG1Q02413 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
DSG1Q02413 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
DSG1Q02413 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
DSG1Q02413 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
DSG1Q02413 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
DSG1Q02413 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
DSG1Q02413 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
DSG1Q02413 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
DSG1Q02413 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
DSG1Q02413 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
DSG1Q02413 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
DSG1Q02413 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
DSG1Q02413 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
DSG1Q02413 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
DSG1Q02413 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC22.94■■□□□ 1.26
DSG1Q02413 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
DSG1Q02413 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
DSG1Q02413 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
DSG1Q02413 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
DSG1Q02413 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
DSG1Q02413 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
DSG1Q02413 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
DSG1Q02413 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
DSG1Q02413 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC22.93■■□□□ 1.26
DSG1Q02413 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
DSG1Q02413 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC22.93■■□□□ 1.26
DSG1Q02413 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
DSG1Q02413 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
DSG1Q02413 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
DSG1Q02413 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
DSG1Q02413 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
DSG1Q02413 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
DSG1Q02413 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
DSG1Q02413 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
DSG1Q02413 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
DSG1Q02413 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
DSG1Q02413 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
DSG1Q02413 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
DSG1Q02413 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
DSG1Q02413 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
DSG1Q02413 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
DSG1Q02413 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
DSG1Q02413 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
DSG1Q02413 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
DSG1Q02413 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
DSG1Q02413 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
DSG1Q02413 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
DSG1Q02413 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
DSG1Q02413 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
DSG1Q02413 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
DSG1Q02413 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
DSG1Q02413 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
DSG1Q02413 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
DSG1Q02413 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
DSG1Q02413 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
DSG1Q02413 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
DSG1Q02413 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
DSG1Q02413 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.3 ms