Protein–RNA interactions for Protein: Q01826

SATB1, DNA-binding protein SATB1, humanhuman

Predictions only

Length 763 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SATB1Q01826 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SATB1Q01826 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SATB1Q01826 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SATB1Q01826 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SATB1Q01826 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SATB1Q01826 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SATB1Q01826 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SATB1Q01826 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SATB1Q01826 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SATB1Q01826 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SATB1Q01826 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SATB1Q01826 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
SATB1Q01826 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SATB1Q01826 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SATB1Q01826 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SATB1Q01826 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SATB1Q01826 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SATB1Q01826 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
SATB1Q01826 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SATB1Q01826 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SATB1Q01826 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SATB1Q01826 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SATB1Q01826 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SATB1Q01826 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SATB1Q01826 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SATB1Q01826 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SATB1Q01826 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SATB1Q01826 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SATB1Q01826 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SATB1Q01826 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SATB1Q01826 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SATB1Q01826 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SATB1Q01826 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SATB1Q01826 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SATB1Q01826 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC22.45■■□□□ 1.19
SATB1Q01826 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.19
SATB1Q01826 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SATB1Q01826 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SATB1Q01826 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SATB1Q01826 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SATB1Q01826 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SATB1Q01826 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SATB1Q01826 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SATB1Q01826 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
SATB1Q01826 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SATB1Q01826 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SATB1Q01826 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SATB1Q01826 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SATB1Q01826 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SATB1Q01826 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SATB1Q01826 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SATB1Q01826 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SATB1Q01826 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SATB1Q01826 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SATB1Q01826 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SATB1Q01826 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SATB1Q01826 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SATB1Q01826 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SATB1Q01826 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
SATB1Q01826 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
SATB1Q01826 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SATB1Q01826 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
SATB1Q01826 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SATB1Q01826 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SATB1Q01826 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SATB1Q01826 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SATB1Q01826 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SATB1Q01826 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SATB1Q01826 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SATB1Q01826 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SATB1Q01826 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SATB1Q01826 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SATB1Q01826 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SATB1Q01826 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SATB1Q01826 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
SATB1Q01826 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SATB1Q01826 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
SATB1Q01826 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SATB1Q01826 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SATB1Q01826 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SATB1Q01826 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SATB1Q01826 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SATB1Q01826 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SATB1Q01826 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SATB1Q01826 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SATB1Q01826 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SATB1Q01826 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SATB1Q01826 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SATB1Q01826 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SATB1Q01826 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SATB1Q01826 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SATB1Q01826 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SATB1Q01826 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SATB1Q01826 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
SATB1Q01826 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SATB1Q01826 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SATB1Q01826 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SATB1Q01826 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SATB1Q01826 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SATB1Q01826 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.8 ms