Protein–RNA interactions for Protein: Q01082

SPTBN1, Spectrin beta chain, non-erythrocytic 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,364 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPTBN1Q01082 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SPTBN1Q01082 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
SPTBN1Q01082 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SPTBN1Q01082 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SPTBN1Q01082 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SPTBN1Q01082 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SPTBN1Q01082 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SPTBN1Q01082 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SPTBN1Q01082 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SPTBN1Q01082 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SPTBN1Q01082 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SPTBN1Q01082 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SPTBN1Q01082 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SPTBN1Q01082 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SPTBN1Q01082 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SPTBN1Q01082 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SPTBN1Q01082 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SPTBN1Q01082 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SPTBN1Q01082 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SPTBN1Q01082 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SPTBN1Q01082 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SPTBN1Q01082 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SPTBN1Q01082 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SPTBN1Q01082 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SPTBN1Q01082 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SPTBN1Q01082 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SPTBN1Q01082 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SPTBN1Q01082 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SPTBN1Q01082 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SPTBN1Q01082 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SPTBN1Q01082 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SPTBN1Q01082 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SPTBN1Q01082 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
SPTBN1Q01082 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
SPTBN1Q01082 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SPTBN1Q01082 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
SPTBN1Q01082 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC19.02■□□□□ 0.63
SPTBN1Q01082 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SPTBN1Q01082 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SPTBN1Q01082 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SPTBN1Q01082 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SPTBN1Q01082 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SPTBN1Q01082 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SPTBN1Q01082 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SPTBN1Q01082 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SPTBN1Q01082 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SPTBN1Q01082 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SPTBN1Q01082 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SPTBN1Q01082 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
SPTBN1Q01082 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
SPTBN1Q01082 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
SPTBN1Q01082 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
SPTBN1Q01082 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC19■□□□□ 0.63
SPTBN1Q01082 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
SPTBN1Q01082 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SPTBN1Q01082 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SPTBN1Q01082 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC19■□□□□ 0.63
SPTBN1Q01082 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SPTBN1Q01082 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
SPTBN1Q01082 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
SPTBN1Q01082 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
SPTBN1Q01082 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
SPTBN1Q01082 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
SPTBN1Q01082 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SPTBN1Q01082 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
SPTBN1Q01082 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC19■□□□□ 0.63
SPTBN1Q01082 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
SPTBN1Q01082 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
SPTBN1Q01082 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SPTBN1Q01082 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SPTBN1Q01082 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
SPTBN1Q01082 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
SPTBN1Q01082 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SPTBN1Q01082 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
SPTBN1Q01082 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
SPTBN1Q01082 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
SPTBN1Q01082 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SPTBN1Q01082 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC18.99■□□□□ 0.63
SPTBN1Q01082 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC18.99■□□□□ 0.63
SPTBN1Q01082 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
SPTBN1Q01082 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
SPTBN1Q01082 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
SPTBN1Q01082 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
SPTBN1Q01082 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SPTBN1Q01082 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
SPTBN1Q01082 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
SPTBN1Q01082 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SPTBN1Q01082 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SPTBN1Q01082 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SPTBN1Q01082 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SPTBN1Q01082 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SPTBN1Q01082 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
SPTBN1Q01082 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SPTBN1Q01082 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SPTBN1Q01082 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
SPTBN1Q01082 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SPTBN1Q01082 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SPTBN1Q01082 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SPTBN1Q01082 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
SPTBN1Q01082 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms