Protein–RNA interactions for Protein: Q00975

CACNA1B, Voltage-dependent N-type calcium channel subunit alpha-1B, humanhuman

Predictions only

Length 2,339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1BQ00975 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CACNA1BQ00975 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
CACNA1BQ00975 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
CACNA1BQ00975 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CACNA1BQ00975 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CACNA1BQ00975 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CACNA1BQ00975 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CACNA1BQ00975 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CACNA1BQ00975 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CACNA1BQ00975 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CACNA1BQ00975 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CACNA1BQ00975 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.82
CACNA1BQ00975 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC20.14■□□□□ 0.82
CACNA1BQ00975 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
CACNA1BQ00975 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.82
CACNA1BQ00975 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.82
CACNA1BQ00975 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CACNA1BQ00975 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CACNA1BQ00975 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CACNA1BQ00975 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CACNA1BQ00975 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CACNA1BQ00975 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CACNA1BQ00975 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CACNA1BQ00975 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CACNA1BQ00975 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CACNA1BQ00975 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CACNA1BQ00975 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CACNA1BQ00975 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CACNA1BQ00975 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CACNA1BQ00975 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CACNA1BQ00975 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CACNA1BQ00975 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CACNA1BQ00975 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CACNA1BQ00975 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CACNA1BQ00975 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CACNA1BQ00975 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CACNA1BQ00975 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CACNA1BQ00975 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CACNA1BQ00975 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CACNA1BQ00975 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
CACNA1BQ00975 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CACNA1BQ00975 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
CACNA1BQ00975 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CACNA1BQ00975 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CACNA1BQ00975 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
CACNA1BQ00975 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CACNA1BQ00975 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CACNA1BQ00975 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CACNA1BQ00975 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CACNA1BQ00975 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
CACNA1BQ00975 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CACNA1BQ00975 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
CACNA1BQ00975 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CACNA1BQ00975 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
CACNA1BQ00975 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
CACNA1BQ00975 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
CACNA1BQ00975 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CACNA1BQ00975 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CACNA1BQ00975 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CACNA1BQ00975 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CACNA1BQ00975 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CACNA1BQ00975 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CACNA1BQ00975 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CACNA1BQ00975 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CACNA1BQ00975 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CACNA1BQ00975 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CACNA1BQ00975 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CACNA1BQ00975 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
CACNA1BQ00975 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CACNA1BQ00975 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CACNA1BQ00975 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CACNA1BQ00975 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CACNA1BQ00975 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CACNA1BQ00975 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CACNA1BQ00975 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CACNA1BQ00975 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
CACNA1BQ00975 TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 609 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CACNA1BQ00975 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CACNA1BQ00975 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CACNA1BQ00975 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CACNA1BQ00975 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CACNA1BQ00975 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CACNA1BQ00975 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CACNA1BQ00975 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
CACNA1BQ00975 AC023511.2-201ENST00000618803 211 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
CACNA1BQ00975 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CACNA1BQ00975 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CACNA1BQ00975 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CACNA1BQ00975 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CACNA1BQ00975 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CACNA1BQ00975 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
CACNA1BQ00975 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CACNA1BQ00975 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CACNA1BQ00975 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
CACNA1BQ00975 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CACNA1BQ00975 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CACNA1BQ00975 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CACNA1BQ00975 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
CACNA1BQ00975 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CACNA1BQ00975 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.2 ms