Protein–RNA interactions for Protein: P84550

SKOR1, SKI family transcriptional corepressor 1, humanhuman

Predictions only

Length 965 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKOR1P84550 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
SKOR1P84550 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SKOR1P84550 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SKOR1P84550 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SKOR1P84550 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SKOR1P84550 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SKOR1P84550 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SKOR1P84550 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SKOR1P84550 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SKOR1P84550 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SKOR1P84550 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SKOR1P84550 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SKOR1P84550 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SKOR1P84550 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SKOR1P84550 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SKOR1P84550 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
SKOR1P84550 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SKOR1P84550 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SKOR1P84550 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SKOR1P84550 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SKOR1P84550 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SKOR1P84550 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SKOR1P84550 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SKOR1P84550 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SKOR1P84550 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SKOR1P84550 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SKOR1P84550 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SKOR1P84550 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SKOR1P84550 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SKOR1P84550 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SKOR1P84550 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SKOR1P84550 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SKOR1P84550 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SKOR1P84550 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SKOR1P84550 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SKOR1P84550 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SKOR1P84550 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SKOR1P84550 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SKOR1P84550 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SKOR1P84550 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SKOR1P84550 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SKOR1P84550 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
SKOR1P84550 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SKOR1P84550 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SKOR1P84550 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SKOR1P84550 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SKOR1P84550 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SKOR1P84550 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SKOR1P84550 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
SKOR1P84550 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SKOR1P84550 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SKOR1P84550 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SKOR1P84550 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SKOR1P84550 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SKOR1P84550 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SKOR1P84550 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SKOR1P84550 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
SKOR1P84550 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
SKOR1P84550 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
SKOR1P84550 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
SKOR1P84550 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SKOR1P84550 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SKOR1P84550 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
SKOR1P84550 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SKOR1P84550 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SKOR1P84550 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SKOR1P84550 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SKOR1P84550 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SKOR1P84550 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SKOR1P84550 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
SKOR1P84550 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SKOR1P84550 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SKOR1P84550 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
SKOR1P84550 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SKOR1P84550 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SKOR1P84550 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SKOR1P84550 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SKOR1P84550 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SKOR1P84550 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SKOR1P84550 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
SKOR1P84550 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SKOR1P84550 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SKOR1P84550 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SKOR1P84550 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SKOR1P84550 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SKOR1P84550 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
SKOR1P84550 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
SKOR1P84550 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
SKOR1P84550 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SKOR1P84550 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
SKOR1P84550 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
SKOR1P84550 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SKOR1P84550 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SKOR1P84550 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SKOR1P84550 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SKOR1P84550 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SKOR1P84550 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SKOR1P84550 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SKOR1P84550 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SKOR1P84550 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.6 ms