Protein–RNA interactions for Protein: P80303

NUCB2, Nucleobindin-2, humanhuman

Predictions only

Length 420 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUCB2P80303 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
NUCB2P80303 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
NUCB2P80303 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
NUCB2P80303 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
NUCB2P80303 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
NUCB2P80303 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
NUCB2P80303 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
NUCB2P80303 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
NUCB2P80303 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
NUCB2P80303 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
NUCB2P80303 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
NUCB2P80303 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
NUCB2P80303 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
NUCB2P80303 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
NUCB2P80303 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
NUCB2P80303 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC25.11■■□□□ 1.61
NUCB2P80303 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
NUCB2P80303 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
NUCB2P80303 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
NUCB2P80303 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
NUCB2P80303 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
NUCB2P80303 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
NUCB2P80303 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
NUCB2P80303 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
NUCB2P80303 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
NUCB2P80303 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
NUCB2P80303 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
NUCB2P80303 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
NUCB2P80303 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
NUCB2P80303 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
NUCB2P80303 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
NUCB2P80303 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
NUCB2P80303 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
NUCB2P80303 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
NUCB2P80303 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
NUCB2P80303 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
NUCB2P80303 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
NUCB2P80303 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
NUCB2P80303 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
NUCB2P80303 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
NUCB2P80303 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
NUCB2P80303 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
NUCB2P80303 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
NUCB2P80303 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
NUCB2P80303 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
NUCB2P80303 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
NUCB2P80303 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
NUCB2P80303 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
NUCB2P80303 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
NUCB2P80303 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
NUCB2P80303 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
NUCB2P80303 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
NUCB2P80303 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
NUCB2P80303 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
NUCB2P80303 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
NUCB2P80303 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
NUCB2P80303 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
NUCB2P80303 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
NUCB2P80303 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
NUCB2P80303 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
NUCB2P80303 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
NUCB2P80303 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
NUCB2P80303 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
NUCB2P80303 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.6
NUCB2P80303 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
NUCB2P80303 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
NUCB2P80303 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
NUCB2P80303 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
NUCB2P80303 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
NUCB2P80303 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
NUCB2P80303 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
NUCB2P80303 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
NUCB2P80303 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
NUCB2P80303 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
NUCB2P80303 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
NUCB2P80303 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
NUCB2P80303 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
NUCB2P80303 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
NUCB2P80303 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
NUCB2P80303 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
NUCB2P80303 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
NUCB2P80303 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC25.06■■□□□ 1.6
NUCB2P80303 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
NUCB2P80303 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
NUCB2P80303 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
NUCB2P80303 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
NUCB2P80303 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
NUCB2P80303 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
NUCB2P80303 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
NUCB2P80303 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
NUCB2P80303 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
NUCB2P80303 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
NUCB2P80303 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
NUCB2P80303 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
NUCB2P80303 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
NUCB2P80303 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
NUCB2P80303 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
NUCB2P80303 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
NUCB2P80303 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
NUCB2P80303 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.1 ms