Protein–RNA interactions for Protein: P78412

IRX6, Iroquois-class homeodomain protein IRX-6, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 446 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRX6P78412 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
IRX6P78412 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
IRX6P78412 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
IRX6P78412 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
IRX6P78412 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
IRX6P78412 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
IRX6P78412 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
IRX6P78412 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
IRX6P78412 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
IRX6P78412 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
IRX6P78412 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.93■■■□□ 2.06
IRX6P78412 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
IRX6P78412 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
IRX6P78412 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
IRX6P78412 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
IRX6P78412 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
IRX6P78412 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
IRX6P78412 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
IRX6P78412 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
IRX6P78412 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
IRX6P78412 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
IRX6P78412 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC27.92■■■□□ 2.06
IRX6P78412 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
IRX6P78412 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
IRX6P78412 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
IRX6P78412 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
IRX6P78412 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
IRX6P78412 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC27.91■■■□□ 2.06
IRX6P78412 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
IRX6P78412 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
IRX6P78412 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
IRX6P78412 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
IRX6P78412 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
IRX6P78412 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
IRX6P78412 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
IRX6P78412 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
IRX6P78412 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
IRX6P78412 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
IRX6P78412 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
IRX6P78412 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
IRX6P78412 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
IRX6P78412 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
IRX6P78412 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC27.9■■■□□ 2.06
IRX6P78412 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
IRX6P78412 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
IRX6P78412 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
IRX6P78412 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
IRX6P78412 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
IRX6P78412 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
IRX6P78412 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
IRX6P78412 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
IRX6P78412 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
IRX6P78412 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
IRX6P78412 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
IRX6P78412 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
IRX6P78412 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
IRX6P78412 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
IRX6P78412 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
IRX6P78412 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
IRX6P78412 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC27.89■■■□□ 2.05
IRX6P78412 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
IRX6P78412 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
IRX6P78412 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
IRX6P78412 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
IRX6P78412 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
IRX6P78412 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
IRX6P78412 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
IRX6P78412 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
IRX6P78412 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
IRX6P78412 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
IRX6P78412 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
IRX6P78412 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
IRX6P78412 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
IRX6P78412 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
IRX6P78412 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
IRX6P78412 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
IRX6P78412 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
IRX6P78412 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
IRX6P78412 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
IRX6P78412 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
IRX6P78412 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
IRX6P78412 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.85■■■□□ 2.05
IRX6P78412 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
IRX6P78412 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
IRX6P78412 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
IRX6P78412 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
IRX6P78412 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
IRX6P78412 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
IRX6P78412 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
IRX6P78412 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
IRX6P78412 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
IRX6P78412 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
IRX6P78412 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
IRX6P78412 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
IRX6P78412 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
IRX6P78412 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
IRX6P78412 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
IRX6P78412 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.84■■■□□ 2.05
IRX6P78412 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC27.84■■■□□ 2.05
IRX6P78412 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.9 ms