Protein–RNA interactions for Protein: P78396

CCNA1, Cyclin-A1, humanhuman

Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNA1P78396 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CCNA1P78396 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CCNA1P78396 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CCNA1P78396 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CCNA1P78396 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CCNA1P78396 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CCNA1P78396 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CCNA1P78396 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CCNA1P78396 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CCNA1P78396 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CCNA1P78396 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
CCNA1P78396 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CCNA1P78396 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
CCNA1P78396 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CCNA1P78396 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CCNA1P78396 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
CCNA1P78396 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
CCNA1P78396 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CCNA1P78396 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CCNA1P78396 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CCNA1P78396 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CCNA1P78396 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CCNA1P78396 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CCNA1P78396 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CCNA1P78396 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CCNA1P78396 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CCNA1P78396 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CCNA1P78396 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CCNA1P78396 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CCNA1P78396 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CCNA1P78396 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CCNA1P78396 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CCNA1P78396 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CCNA1P78396 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CCNA1P78396 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
CCNA1P78396 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CCNA1P78396 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CCNA1P78396 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CCNA1P78396 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CCNA1P78396 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CCNA1P78396 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CCNA1P78396 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CCNA1P78396 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CCNA1P78396 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CCNA1P78396 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CCNA1P78396 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CCNA1P78396 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CCNA1P78396 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
CCNA1P78396 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CCNA1P78396 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CCNA1P78396 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CCNA1P78396 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CCNA1P78396 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CCNA1P78396 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CCNA1P78396 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CCNA1P78396 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CCNA1P78396 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CCNA1P78396 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CCNA1P78396 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CCNA1P78396 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CCNA1P78396 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CCNA1P78396 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CCNA1P78396 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CCNA1P78396 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CCNA1P78396 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CCNA1P78396 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CCNA1P78396 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CCNA1P78396 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CCNA1P78396 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CCNA1P78396 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CCNA1P78396 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CCNA1P78396 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
CCNA1P78396 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CCNA1P78396 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CCNA1P78396 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CCNA1P78396 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CCNA1P78396 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CCNA1P78396 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CCNA1P78396 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
CCNA1P78396 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CCNA1P78396 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CCNA1P78396 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CCNA1P78396 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
CCNA1P78396 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CCNA1P78396 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CCNA1P78396 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
CCNA1P78396 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CCNA1P78396 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CCNA1P78396 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CCNA1P78396 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
CCNA1P78396 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CCNA1P78396 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CCNA1P78396 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
CCNA1P78396 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CCNA1P78396 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CCNA1P78396 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CCNA1P78396 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CCNA1P78396 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CCNA1P78396 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
CCNA1P78396 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.7 ms