Protein–RNA interactions for Protein: P63162

SNRPN, Small nuclear ribonucleoprotein-associated protein N, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 240 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNRPNP63162 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SNRPNP63162 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SNRPNP63162 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SNRPNP63162 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SNRPNP63162 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SNRPNP63162 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SNRPNP63162 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SNRPNP63162 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SNRPNP63162 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SNRPNP63162 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SNRPNP63162 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
SNRPNP63162 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
SNRPNP63162 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SNRPNP63162 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SNRPNP63162 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SNRPNP63162 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SNRPNP63162 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SNRPNP63162 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
SNRPNP63162 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SNRPNP63162 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SNRPNP63162 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SNRPNP63162 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
SNRPNP63162 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SNRPNP63162 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SNRPNP63162 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SNRPNP63162 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SNRPNP63162 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SNRPNP63162 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SNRPNP63162 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SNRPNP63162 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SNRPNP63162 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SNRPNP63162 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SNRPNP63162 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SNRPNP63162 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SNRPNP63162 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SNRPNP63162 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SNRPNP63162 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SNRPNP63162 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SNRPNP63162 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SNRPNP63162 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SNRPNP63162 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SNRPNP63162 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SNRPNP63162 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SNRPNP63162 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SNRPNP63162 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SNRPNP63162 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SNRPNP63162 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SNRPNP63162 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SNRPNP63162 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SNRPNP63162 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SNRPNP63162 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SNRPNP63162 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SNRPNP63162 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SNRPNP63162 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SNRPNP63162 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SNRPNP63162 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
SNRPNP63162 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SNRPNP63162 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SNRPNP63162 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SNRPNP63162 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
SNRPNP63162 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SNRPNP63162 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SNRPNP63162 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
SNRPNP63162 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SNRPNP63162 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SNRPNP63162 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SNRPNP63162 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SNRPNP63162 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SNRPNP63162 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SNRPNP63162 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
SNRPNP63162 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC20.4■□□□□ 0.86
SNRPNP63162 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SNRPNP63162 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SNRPNP63162 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SNRPNP63162 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
SNRPNP63162 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
SNRPNP63162 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
SNRPNP63162 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SNRPNP63162 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SNRPNP63162 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC20.4■□□□□ 0.86
SNRPNP63162 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
SNRPNP63162 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
SNRPNP63162 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
SNRPNP63162 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
SNRPNP63162 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
SNRPNP63162 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
SNRPNP63162 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
SNRPNP63162 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
SNRPNP63162 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SNRPNP63162 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SNRPNP63162 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
SNRPNP63162 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SNRPNP63162 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SNRPNP63162 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SNRPNP63162 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SNRPNP63162 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
SNRPNP63162 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
SNRPNP63162 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SNRPNP63162 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
SNRPNP63162 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.9 ms