Protein–RNA interactions for Protein: P62684

HERVK_113, Endogenous retrovirus group K member 113 Gag polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 666 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERVK_113P62684 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
HERVK_113P62684 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC25■■□□□ 1.59
HERVK_113P62684 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
HERVK_113P62684 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
HERVK_113P62684 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
HERVK_113P62684 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC25■■□□□ 1.59
HERVK_113P62684 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC25■■□□□ 1.59
HERVK_113P62684 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
HERVK_113P62684 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
HERVK_113P62684 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
HERVK_113P62684 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
HERVK_113P62684 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
HERVK_113P62684 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
HERVK_113P62684 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
HERVK_113P62684 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
HERVK_113P62684 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
HERVK_113P62684 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
HERVK_113P62684 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
HERVK_113P62684 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
HERVK_113P62684 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
HERVK_113P62684 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
HERVK_113P62684 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
HERVK_113P62684 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
HERVK_113P62684 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
HERVK_113P62684 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
HERVK_113P62684 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
HERVK_113P62684 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
HERVK_113P62684 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
HERVK_113P62684 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
HERVK_113P62684 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
HERVK_113P62684 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
HERVK_113P62684 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
HERVK_113P62684 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
HERVK_113P62684 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
HERVK_113P62684 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC24.98■■□□□ 1.59
HERVK_113P62684 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
HERVK_113P62684 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
HERVK_113P62684 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
HERVK_113P62684 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
HERVK_113P62684 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
HERVK_113P62684 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
HERVK_113P62684 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
HERVK_113P62684 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
HERVK_113P62684 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
HERVK_113P62684 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
HERVK_113P62684 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
HERVK_113P62684 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
HERVK_113P62684 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
HERVK_113P62684 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
HERVK_113P62684 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
HERVK_113P62684 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
HERVK_113P62684 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
HERVK_113P62684 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
HERVK_113P62684 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
HERVK_113P62684 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
HERVK_113P62684 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
HERVK_113P62684 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
HERVK_113P62684 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
HERVK_113P62684 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
HERVK_113P62684 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
HERVK_113P62684 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
HERVK_113P62684 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
HERVK_113P62684 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.59
HERVK_113P62684 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
HERVK_113P62684 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
HERVK_113P62684 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
HERVK_113P62684 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
HERVK_113P62684 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.95■■□□□ 1.58
HERVK_113P62684 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
HERVK_113P62684 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
HERVK_113P62684 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
HERVK_113P62684 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
HERVK_113P62684 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
HERVK_113P62684 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
HERVK_113P62684 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
HERVK_113P62684 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
HERVK_113P62684 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
HERVK_113P62684 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
HERVK_113P62684 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
HERVK_113P62684 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
HERVK_113P62684 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
HERVK_113P62684 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
HERVK_113P62684 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
HERVK_113P62684 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
HERVK_113P62684 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
HERVK_113P62684 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
HERVK_113P62684 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
HERVK_113P62684 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
HERVK_113P62684 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
HERVK_113P62684 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
HERVK_113P62684 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC24.93■■□□□ 1.58
HERVK_113P62684 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
HERVK_113P62684 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC24.93■■□□□ 1.58
HERVK_113P62684 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
HERVK_113P62684 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
HERVK_113P62684 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
HERVK_113P62684 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
HERVK_113P62684 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
HERVK_113P62684 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
HERVK_113P62684 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.6 ms