Protein–RNA interactions for Protein: P62316

SNRPD2, Small nuclear ribonucleoprotein Sm D2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 118 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNRPD2P62316 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SNRPD2P62316 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SNRPD2P62316 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SNRPD2P62316 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SNRPD2P62316 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SNRPD2P62316 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SNRPD2P62316 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SNRPD2P62316 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SNRPD2P62316 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SNRPD2P62316 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SNRPD2P62316 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SNRPD2P62316 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SNRPD2P62316 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SNRPD2P62316 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SNRPD2P62316 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SNRPD2P62316 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SNRPD2P62316 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SNRPD2P62316 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
SNRPD2P62316 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SNRPD2P62316 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SNRPD2P62316 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SNRPD2P62316 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SNRPD2P62316 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SNRPD2P62316 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SNRPD2P62316 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SNRPD2P62316 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SNRPD2P62316 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
SNRPD2P62316 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SNRPD2P62316 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SNRPD2P62316 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SNRPD2P62316 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SNRPD2P62316 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SNRPD2P62316 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SNRPD2P62316 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SNRPD2P62316 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SNRPD2P62316 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SNRPD2P62316 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SNRPD2P62316 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SNRPD2P62316 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SNRPD2P62316 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SNRPD2P62316 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SNRPD2P62316 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SNRPD2P62316 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SNRPD2P62316 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SNRPD2P62316 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SNRPD2P62316 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
SNRPD2P62316 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SNRPD2P62316 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
SNRPD2P62316 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SNRPD2P62316 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SNRPD2P62316 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SNRPD2P62316 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SNRPD2P62316 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SNRPD2P62316 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SNRPD2P62316 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SNRPD2P62316 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SNRPD2P62316 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SNRPD2P62316 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SNRPD2P62316 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
SNRPD2P62316 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SNRPD2P62316 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SNRPD2P62316 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SNRPD2P62316 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SNRPD2P62316 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SNRPD2P62316 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SNRPD2P62316 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SNRPD2P62316 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SNRPD2P62316 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SNRPD2P62316 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SNRPD2P62316 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SNRPD2P62316 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SNRPD2P62316 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SNRPD2P62316 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SNRPD2P62316 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
SNRPD2P62316 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SNRPD2P62316 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SNRPD2P62316 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SNRPD2P62316 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SNRPD2P62316 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SNRPD2P62316 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SNRPD2P62316 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SNRPD2P62316 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SNRPD2P62316 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SNRPD2P62316 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SNRPD2P62316 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SNRPD2P62316 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SNRPD2P62316 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SNRPD2P62316 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
SNRPD2P62316 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
SNRPD2P62316 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
SNRPD2P62316 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
SNRPD2P62316 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
SNRPD2P62316 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
SNRPD2P62316 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
SNRPD2P62316 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
SNRPD2P62316 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
SNRPD2P62316 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
SNRPD2P62316 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SNRPD2P62316 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
SNRPD2P62316 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.5 ms