Protein–RNA interactions for Protein: P59990

KRTAP12-1, Keratin-associated protein 12-1, humanhuman

Predictions only

Length 96 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP12-1P59990 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC9.59□□□□□ -0.87
KRTAP12-1P59990 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC9.59□□□□□ -0.87
KRTAP12-1P59990 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
KRTAP12-1P59990 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
KRTAP12-1P59990 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
KRTAP12-1P59990 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
KRTAP12-1P59990 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
KRTAP12-1P59990 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
KRTAP12-1P59990 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.59□□□□□ -0.87
KRTAP12-1P59990 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
KRTAP12-1P59990 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
KRTAP12-1P59990 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
KRTAP12-1P59990 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
KRTAP12-1P59990 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
KRTAP12-1P59990 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
KRTAP12-1P59990 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
KRTAP12-1P59990 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
KRTAP12-1P59990 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
KRTAP12-1P59990 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
KRTAP12-1P59990 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
KRTAP12-1P59990 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
KRTAP12-1P59990 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
KRTAP12-1P59990 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
KRTAP12-1P59990 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC9.58□□□□□ -0.88
KRTAP12-1P59990 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
KRTAP12-1P59990 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
KRTAP12-1P59990 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
KRTAP12-1P59990 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC9.58□□□□□ -0.88
KRTAP12-1P59990 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
KRTAP12-1P59990 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
KRTAP12-1P59990 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC9.58□□□□□ -0.88
KRTAP12-1P59990 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
KRTAP12-1P59990 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
KRTAP12-1P59990 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
KRTAP12-1P59990 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
KRTAP12-1P59990 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
KRTAP12-1P59990 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
KRTAP12-1P59990 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC9.58□□□□□ -0.88
KRTAP12-1P59990 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
KRTAP12-1P59990 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
KRTAP12-1P59990 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
KRTAP12-1P59990 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
KRTAP12-1P59990 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC9.58□□□□□ -0.88
KRTAP12-1P59990 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
KRTAP12-1P59990 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.58□□□□□ -0.88
KRTAP12-1P59990 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
KRTAP12-1P59990 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
KRTAP12-1P59990 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
KRTAP12-1P59990 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC9.58□□□□□ -0.88
KRTAP12-1P59990 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
KRTAP12-1P59990 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
KRTAP12-1P59990 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.58□□□□□ -0.88
KRTAP12-1P59990 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
KRTAP12-1P59990 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
KRTAP12-1P59990 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC9.58□□□□□ -0.88
KRTAP12-1P59990 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
KRTAP12-1P59990 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
KRTAP12-1P59990 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
KRTAP12-1P59990 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC9.58□□□□□ -0.88
KRTAP12-1P59990 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
KRTAP12-1P59990 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
KRTAP12-1P59990 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
KRTAP12-1P59990 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC9.57□□□□□ -0.88
KRTAP12-1P59990 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC9.57□□□□□ -0.88
KRTAP12-1P59990 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC9.57□□□□□ -0.88
KRTAP12-1P59990 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC9.57□□□□□ -0.88
KRTAP12-1P59990 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC9.57□□□□□ -0.88
KRTAP12-1P59990 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC9.57□□□□□ -0.88
KRTAP12-1P59990 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
KRTAP12-1P59990 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
KRTAP12-1P59990 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
KRTAP12-1P59990 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
KRTAP12-1P59990 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC9.57□□□□□ -0.88
KRTAP12-1P59990 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
KRTAP12-1P59990 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC9.57□□□□□ -0.88
KRTAP12-1P59990 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC9.57□□□□□ -0.88
KRTAP12-1P59990 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
KRTAP12-1P59990 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
KRTAP12-1P59990 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
KRTAP12-1P59990 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
KRTAP12-1P59990 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
KRTAP12-1P59990 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.57□□□□□ -0.88
KRTAP12-1P59990 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
KRTAP12-1P59990 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
KRTAP12-1P59990 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
KRTAP12-1P59990 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
KRTAP12-1P59990 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
KRTAP12-1P59990 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
KRTAP12-1P59990 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
KRTAP12-1P59990 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
KRTAP12-1P59990 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
KRTAP12-1P59990 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
KRTAP12-1P59990 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
KRTAP12-1P59990 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
KRTAP12-1P59990 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
KRTAP12-1P59990 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
KRTAP12-1P59990 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
KRTAP12-1P59990 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
KRTAP12-1P59990 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
KRTAP12-1P59990 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.5 ms