Protein–RNA interactions for Protein: P57075

UBASH3A, Ubiquitin-associated and SH3 domain-containing protein A, humanhuman

Predictions only

Length 661 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBASH3AP57075 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
UBASH3AP57075 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
UBASH3AP57075 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
UBASH3AP57075 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
UBASH3AP57075 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
UBASH3AP57075 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
UBASH3AP57075 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
UBASH3AP57075 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
UBASH3AP57075 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
UBASH3AP57075 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
UBASH3AP57075 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
UBASH3AP57075 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
UBASH3AP57075 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
UBASH3AP57075 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
UBASH3AP57075 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
UBASH3AP57075 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
UBASH3AP57075 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
UBASH3AP57075 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
UBASH3AP57075 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
UBASH3AP57075 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
UBASH3AP57075 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
UBASH3AP57075 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
UBASH3AP57075 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
UBASH3AP57075 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
UBASH3AP57075 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
UBASH3AP57075 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
UBASH3AP57075 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
UBASH3AP57075 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.38
UBASH3AP57075 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC23.64■■□□□ 1.38
UBASH3AP57075 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
UBASH3AP57075 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.38
UBASH3AP57075 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
UBASH3AP57075 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
UBASH3AP57075 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
UBASH3AP57075 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
UBASH3AP57075 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
UBASH3AP57075 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
UBASH3AP57075 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
UBASH3AP57075 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
UBASH3AP57075 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
UBASH3AP57075 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
UBASH3AP57075 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
UBASH3AP57075 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
UBASH3AP57075 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
UBASH3AP57075 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
UBASH3AP57075 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
UBASH3AP57075 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
UBASH3AP57075 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
UBASH3AP57075 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
UBASH3AP57075 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
UBASH3AP57075 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
UBASH3AP57075 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
UBASH3AP57075 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
UBASH3AP57075 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
UBASH3AP57075 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
UBASH3AP57075 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
UBASH3AP57075 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
UBASH3AP57075 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
UBASH3AP57075 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
UBASH3AP57075 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
UBASH3AP57075 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
UBASH3AP57075 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
UBASH3AP57075 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
UBASH3AP57075 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
UBASH3AP57075 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
UBASH3AP57075 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
UBASH3AP57075 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
UBASH3AP57075 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
UBASH3AP57075 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
UBASH3AP57075 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
UBASH3AP57075 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
UBASH3AP57075 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
UBASH3AP57075 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
UBASH3AP57075 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
UBASH3AP57075 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
UBASH3AP57075 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
UBASH3AP57075 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
UBASH3AP57075 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
UBASH3AP57075 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
UBASH3AP57075 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
UBASH3AP57075 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
UBASH3AP57075 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
UBASH3AP57075 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
UBASH3AP57075 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
UBASH3AP57075 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
UBASH3AP57075 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
UBASH3AP57075 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
UBASH3AP57075 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
UBASH3AP57075 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
UBASH3AP57075 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
UBASH3AP57075 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
UBASH3AP57075 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
UBASH3AP57075 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
UBASH3AP57075 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
UBASH3AP57075 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
UBASH3AP57075 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
UBASH3AP57075 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
UBASH3AP57075 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
UBASH3AP57075 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
UBASH3AP57075 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.7 ms