Protein–RNA interactions for Protein: P56915

GSC, Homeobox protein goosecoid, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 257 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GSCP56915 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GSCP56915 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GSCP56915 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
GSCP56915 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GSCP56915 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
GSCP56915 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
GSCP56915 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GSCP56915 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GSCP56915 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GSCP56915 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
GSCP56915 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
GSCP56915 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GSCP56915 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
GSCP56915 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC22.72■■□□□ 1.23
GSCP56915 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
GSCP56915 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
GSCP56915 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC22.72■■□□□ 1.23
GSCP56915 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
GSCP56915 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
GSCP56915 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
GSCP56915 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GSCP56915 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GSCP56915 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GSCP56915 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
GSCP56915 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
GSCP56915 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
GSCP56915 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
GSCP56915 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
GSCP56915 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
GSCP56915 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
GSCP56915 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
GSCP56915 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
GSCP56915 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
GSCP56915 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
GSCP56915 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
GSCP56915 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
GSCP56915 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
GSCP56915 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
GSCP56915 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
GSCP56915 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
GSCP56915 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
GSCP56915 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
GSCP56915 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
GSCP56915 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
GSCP56915 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
GSCP56915 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
GSCP56915 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
GSCP56915 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
GSCP56915 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
GSCP56915 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
GSCP56915 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
GSCP56915 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
GSCP56915 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
GSCP56915 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
GSCP56915 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
GSCP56915 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GSCP56915 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
GSCP56915 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GSCP56915 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GSCP56915 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GSCP56915 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
GSCP56915 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GSCP56915 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GSCP56915 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GSCP56915 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
GSCP56915 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
GSCP56915 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
GSCP56915 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
GSCP56915 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
GSCP56915 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GSCP56915 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
GSCP56915 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
GSCP56915 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GSCP56915 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
GSCP56915 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GSCP56915 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GSCP56915 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
GSCP56915 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
GSCP56915 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GSCP56915 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
GSCP56915 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GSCP56915 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
GSCP56915 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GSCP56915 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
GSCP56915 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
GSCP56915 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
GSCP56915 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
GSCP56915 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
GSCP56915 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
GSCP56915 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
GSCP56915 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
GSCP56915 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
GSCP56915 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
GSCP56915 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
GSCP56915 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
GSCP56915 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
GSCP56915 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
GSCP56915 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
GSCP56915 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
GSCP56915 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20 ms