Protein–RNA interactions for Protein: P56182

RRP1, Ribosomal RNA processing protein 1 homolog A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 461 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RRP1P56182 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
RRP1P56182 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
RRP1P56182 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
RRP1P56182 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
RRP1P56182 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
RRP1P56182 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
RRP1P56182 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
RRP1P56182 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
RRP1P56182 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
RRP1P56182 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
RRP1P56182 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
RRP1P56182 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
RRP1P56182 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
RRP1P56182 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
RRP1P56182 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
RRP1P56182 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
RRP1P56182 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
RRP1P56182 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
RRP1P56182 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
RRP1P56182 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
RRP1P56182 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
RRP1P56182 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
RRP1P56182 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
RRP1P56182 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
RRP1P56182 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
RRP1P56182 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC27.64■■■□□ 2.02
RRP1P56182 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
RRP1P56182 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
RRP1P56182 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
RRP1P56182 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
RRP1P56182 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
RRP1P56182 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
RRP1P56182 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
RRP1P56182 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
RRP1P56182 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
RRP1P56182 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.01
RRP1P56182 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
RRP1P56182 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.01
RRP1P56182 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
RRP1P56182 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
RRP1P56182 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.63■■■□□ 2.01
RRP1P56182 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
RRP1P56182 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
RRP1P56182 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
RRP1P56182 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
RRP1P56182 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
RRP1P56182 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
RRP1P56182 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
RRP1P56182 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
RRP1P56182 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
RRP1P56182 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
RRP1P56182 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
RRP1P56182 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
RRP1P56182 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
RRP1P56182 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
RRP1P56182 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
RRP1P56182 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
RRP1P56182 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
RRP1P56182 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
RRP1P56182 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
RRP1P56182 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
RRP1P56182 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC27.61■■■□□ 2.01
RRP1P56182 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
RRP1P56182 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
RRP1P56182 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
RRP1P56182 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
RRP1P56182 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
RRP1P56182 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
RRP1P56182 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
RRP1P56182 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
RRP1P56182 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
RRP1P56182 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
RRP1P56182 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
RRP1P56182 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.6■■■□□ 2.01
RRP1P56182 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
RRP1P56182 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
RRP1P56182 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.6■■■□□ 2.01
RRP1P56182 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
RRP1P56182 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
RRP1P56182 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
RRP1P56182 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
RRP1P56182 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
RRP1P56182 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
RRP1P56182 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
RRP1P56182 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
RRP1P56182 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
RRP1P56182 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC27.59■■■□□ 2.01
RRP1P56182 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
RRP1P56182 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
RRP1P56182 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
RRP1P56182 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
RRP1P56182 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
RRP1P56182 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
RRP1P56182 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
RRP1P56182 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
RRP1P56182 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
RRP1P56182 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
RRP1P56182 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
RRP1P56182 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
RRP1P56182 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.4 ms